兰州鲇皮肤与脾转录组比较及Galectin-3与LITAF基因分子特征分析  

Comparative analysis of skin and spleen transcriptome and molecular characterization of Galectin-3 and LITAF genes in Silurus lanzhouensis

作　　者：朱子琳 李锋刚 张亚萌 周继术[1] 杨元昊 Zhu Zilin

机构地区：[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100 [2]陕西省水产研究与技术推广总站,陕西西安710086

出　　处：《江苏农业科学》2025年第3期23-34,共12页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：农业农村部财政专项(编号:HHDC-2022-0302)。

摘　　要：兰州鲇(Silurus lanzhouensis)是黄河中上游特有土著鱼类,其自然种群数量稀少,已被列入《中国物种红色名录》。为了解兰州鲇皮肤和脾2个重要免疫器官在免疫过程中发挥的不同功能,本研究以野生兰州鲇作为研究对象,对其皮肤和脾进行转录组测序分析。结果表明,兰州鲇的皮肤和脾中共有6627个差异表达基因(DEG)。KEGG富集分析结果表明,共有59个DEG富集到Toll样受体信号通路、RIG-I样受体信号通路等11个免疫相关通路中。这表明兰州鲇的皮肤与脾的免疫功能有较大差异。通过DEG分析,还发现半乳糖凝集素3(galectin-3)及脂多糖诱导的肿瘤坏死因子(LITAF)2个先天免疫相关基因发生了显著的差异性表达。组织表达模式分析结果表明,galectin-3是兰州鲇皮肤高表达基因,而LITAF基因在6个组织中均有表达,显示出galectin-3主要在兰州鲇皮肤屏障的先天免疫中发挥着重要的免疫防御作用,而LITAF则广泛参与兰州鲇机体的免疫防御。通过多序列比对及蛋白质结构预测可知,Galectin-3与LITAF的氨基酸序列在硬骨鱼中是保守的。

关 键 词：兰州鲇 皮肤 脾 转录组 GALECTIN-3 LITAF 蛋白质结构及功能预测 

分 类 号：S917[农业科学—水产科学]