诗琳通木兰bHLH基因家族生物信息学及表达分析  

Bioinformatics and expression analysis of bHLH gene family in Magnolia sirindhorniae

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作  者:谢微 张宝津 石洁 刘世晗 肖菲 王兰 邓小梅 Xie Wei

机构地区:[1]华南农业大学林学与风景园林学院,广东广州510642

出  处:《江苏农业科学》2025年第4期141-153,共13页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:广东省林业科技创新项目(编号:2023KJCX002)。

摘  要:诗琳通木兰(Magnolia sirindhorniae Noot.&Chalermglin)作为木兰科园林绿化优良新品种,具有极高的经济价值和生态效益。bHLH转录因子为植物第二大转录因子基因家族,在植物抗逆方面发挥重要作用。本研究基于盐碱胁迫下诗琳通木兰转录组,鉴定诗琳通木兰bHLH基因家族成员,利用生物信息学分析诗琳通木兰bHLH转录因子的蛋白理化性质、二级结构、系统发育和保守基序等特征,结合盐碱胁迫中诗琳通木兰叶和根的基因表达分析,筛选出与盐碱胁迫响应相关的bHLH。结果表明,诗琳通木兰鉴定出72个bHLH保守结构域的成员,蛋白大小在72~736 aa之间,均为亲水蛋白,MsbHLH蛋白亚细胞定位预测显示,大部分bHLH存在于细胞核中。将系统发育进化树分成23个亚家族,诗琳通木兰分布在17个亚组中,组内基因结构相似,都具有相同的motif1和motif2。诗琳通木兰bHLH基因表达分析结果显示,差异基因MsbHLH13、MsbHLH14表达量发生显著变化,可能与诗琳通木兰的耐盐碱能力相关。本研究结果为进一步深入研究MsbHLH转录因子响应盐碱胁迫的分子响应机制奠定基础。

关 键 词:诗琳通木兰 bHLH基因家族 盐碱胁迫 基因表达 

分 类 号:S188[农业科学—农业基础科学] S718.43

 

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