小麦TaOEE1-2D基因的生物信息学及表达分析  

Bioinformatics and expression analysis of wheat TaOEE1-2D gene

作　　者：赵鹏鹏 李鲁华 任明见[1,2] 洪鼎立 李欣 徐如宏[1,2] Zhao Pengpeng

机构地区：[1]贵州大学农学院,贵州贵阳550025 [2]国家小麦改良中心贵阳分中心,贵州贵阳550025

出　　处：《江苏农业科学》2025年第4期154-161,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：贵州省科技支撑计划(编号:黔科合支撑[2021]一般272);贵州省科技计划(编号:黔科合基础[2020]1Z018号)。

摘　　要：放氧增强蛋白1(oxygen-evolving enhancer protein 1,OEE1)是光系统Ⅱ(PSⅡ)中由PsbO基因编码的蛋白,在光系统的放氧活动中起到重要作用。为了进一步研究其生物学功能,对TaOEE1基因进行生物信息学、组织表达模式和逆境胁迫下的表达分析。转录组数据分析结果显示,TaOEE1-2D基因的表达量在小麦籽粒灌浆过程中呈下调趋势,并且在不同胁迫条件下呈现差异表达。生物信息学分析结果表明,TaOEE1-2D蛋白的氨基酸长度为328 aa,相对分子量为34428.93,总平均亲水性为-0.264,不稳定系数为37.05,为亲水性不稳定蛋白;TaOEE1-2D属于MSP超家族。二级结构分析结果显示,TaOEE1-2D由β-转角、α-螺旋、延伸链片层、无规则卷曲等二级结构组成,其中无规则卷曲占比最高,有153个氨基酸,占46.65%。TaOEE1-2D定位于叶绿体中,不具有跨膜结构域。顺式作用元件分析结果显示,TaOEE1-2D基因启动子区包含ABRE、MBS等相关顺式作用元件。进化树分析结果表明,TaOEE1-2D和TdOEE1-2B的亲缘关系最近,序列相似度为99.70%。组织特异性表达分析结果显示,TaOEE1-2D在叶中的相对表达量最高,在根中的相对表达量最低。PEG 6000与盐胁迫均能够显著下调TaOEE1-2D的相对表达量,表明TaOEE1-2D能响应非生物胁迫。

关 键 词：小麦 TaOEE1 生物信息学 表达分析 非生物胁迫 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学] S512.101S512.103.2