柑橘NHX基因的鉴定及盐胁迫下表达分析  

Identification of NHX gene in citrus and its expression analysis under salt stress

作　　者：岳杨 张德健 王鹏[2] 金龙飞 Yue Yang

机构地区：[1]长江大学园艺园林学院,湖北荆州434025 [2]浙江省柑橘研究所,浙江台州318026 [3]海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南海口570100

出　　处：《江苏农业科学》2025年第4期161-168,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：海南省热带园艺作物品质调控重点实验室开放课题[编号:HNZDSYS(23)-04];浙江省基础公益研究计划(编号:LTGN23C150001)。

摘　　要：为研究柑橘NHX基因家族的生物学特性,利用生物信息学方法从枳全基因组数据库筛选出8个NHX基因,并对其基因结构、亚细胞定位、保守序列、启动子顺势作用元件、共线性、进化关系以及在枳和酸橙中的表达特征进行分析。结果表明,8个PtNHXs基因分布在6条染色体上,进化关系上可以分为3个亚族,编码的蛋白质氨基酸数为250~1128 aa,分子量为27.64~125.20 ku,等电点为5.11~9.36,亲水系数为0.022~0.797,均为疏水性蛋白。亚细胞定位预测表明,PtNHX2和PtNHX8位于细胞膜,其余6个成员均位于液泡。8个PtNHX外显子数量为8~24个,含有的motif数量介于5~9个之间,均含有motif3,启动子顺势作用元件分析发现NHX的启动子中含有大量光、逆境胁迫和激素响应的元件。共线性分析结果显示,枳的物种内有2对共线性关系,枳与拟南芥之间有8对共线性关系。qRT-PCR结果发现,NHX1、NHX5、NHX7在枳中的表达量受盐胁迫诱导,可作为后续柑橘耐盐研究的候选基因。NHX2和NHX8在酸橙中的表达量显著高于枳,这可能是酸橙比枳耐盐的原因之一。结果可为进一步探索柑橘NHX基因的潜在机制及盐胁迫下候选基因的挖掘提供了理论基础。

关 键 词：柑橘 NHX 生物信息学 基因表达 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学] S666.01