基于生物信息学单细胞测序芯片分析预测及验证糖尿病肾脏疾病诊断基因  

作　　者：刘灿仙 彭紫凝 陈怡鑫 范译丹 陈芳芳 范源 

机构地区：[1]云南中医药大学第一临床医学院,昆明650500 [2]云南中医药大学第二附属医院,昆明650200 [3]云南中医药大学第一附属医院,昆明650532

出　　处：《中国中西医结合肾病杂志》2025年第3期236-238,I0003-I0005,共6页Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Nephrology

基　　金：云南省科技厅科技计划项目-应用基础研究计划(No.202101AZ010001-015);云南省“万人计划”名医专项项目(No.YNWR-MY-2020-084);云南省科技人才与平台计划项目(No.202105AE160018);云南中医药大学第二附属医院国医大师张震工作室项目。

摘　　要：目的:基于生物信息学单细胞测序芯片分析预测糖尿病肾脏疾病(DKD)的发病机制,结合蛋白质互作网络(PPI)分析筛选DKD发病的关键诊断基因。方法:采用基因表达综合库(GEO)中单细胞测序芯片GSE30528、GSE1009和GSE30529的数据,对GSE30528、GSE1009芯片分析符合P<0.05和|log_(2)(fold change)|>1的差异表达基因(DEGs),进行GO和KEGG富集分析,建立PPI网络图和hub基因图,明确hub基因,最终采用GSE30529芯片数据验证hub基因。结果:两组芯片数据筛选出277个DEGs,GO富集表现在肾脏发展过程、肾系统发育过程、含胶原的细胞外基质组分等628种生物学功能协同促进DKD,KEGG分析显示AGE-RAGE、PI3K-Akt等为DKD发病关键信号通路。PPI筛选及单细胞测序芯片验证后,预测NPHS1、CSF1R、CD2AP、TYROBP、IL7R、FYN和COL1A2为DKD诊断基因,其中它们主要来源肾小球足细胞。结论:本研究从生物信息学单细胞测序数据库分析、验证,了解DKD发病的潜在分子机制,预测关键诊断基因和潜在治疗靶点,为进一步研究奠定坚实基础。

关 键 词：生物信息学 单细胞测序芯片 糖尿病肾脏疾病 诊断基因 

分 类 号：R587.2[医药卫生—内分泌]