禽腺病毒8a型贵州株的Penton基因遗传进化分析及其编码蛋白结构预测  

Genetic Evolution Analysis of Penton Gene and Prediction of Encoded Protein Structure of Avian Adenovirus Type 8a Guizhou Strain

作　　者：洪清峰 韩帅博 朱二鹏 赵超 龙秀文 张妹妹 余琴 欧萍 程振涛 Hong Qingfeng

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵州贵阳550025

出　　处：《贵州畜牧兽医》2025年第2期20-23,共4页Guizhou Journal of Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基　　金：“FAdV-4和FAdV-8a Penton蛋白二价亚单位疫苗的构建与免疫效果分析”大学生创新创业训练计划项目(贵大[省]创字2023[030]号);“动物病原分子特征与致病机制研究”贵州省科技支撑计划项目(黔科合平台人才[2021]5646号);“安卡拉病毒贵州株生物学特性与致病机理研究”贵州省科技支撑计划项目(黔科合基础[2020]1Y409)。

摘　　要：为了解禽腺病毒8a型(FAdV-8a)贵州株GZ-8a的遗传进化情况及其Penton基因编码蛋白的结构,对pMD19-T-FAdV-8a-Penton阳性克隆质粒进行测序,利用DNAStar的MEGA软件构建遗传进化树并进行同源性分析;分别通过在线软件ProtParam分析理化性质,Protscale分析亲疏水性,SignalP-6.0预测蛋白质信号肽,TMHMM 2.0分析跨膜域,SOPMA预测二级结构,SWISS-MODEL预测三级结构,通过GMQE和QMEANDisCo Global的数值评估模型质量,并将预测的三级结构与模型6qi5.1.T比较覆盖率与相似度。结果:贵州株GZ-8a与河南株HLJ1968的同源性最高,亲缘关系最近;不同地区FAdV-E的Penton基因同源性为99.5%~100%,变异程度低。GZ-8a Penton基因序列共编码553个氨基酸,GZ-8a Penton蛋白分子质量为59 868.46 Da,属于亲水性酸性蛋白,不存在信号肽且无跨膜结构;Penton蛋白分子的二、三级结构α螺旋占21.70%,无规卷曲占55.52%,扩展链占22.78%,以无规卷曲为主要结构;蛋白GMQE值为0.69,QMEANDisCo Global值为0.66±0.05;与模型6qi5.1.T相比,覆盖率为81%,相似度为45%,匹配度较高。

关 键 词：禽腺病毒8a 贵州株GZ-8a Penton基因 遗传进化 蛋白质结构 

分 类 号：S852.659.1[农业科学—基础兽医学] Q75[农业科学—兽医学]