志贺氏菌属各亚群菌株基因组“共有骨架”组成的分析  

作　　者：刘红[1] 彭俊平[1] 杨剑[1] 孙立连[1] 陈淑霞[1] 金奇[1] 

机构地区：[1]病毒基因工程国家重点实验室

出　　处：《科学通报》2003年第23期2451-2456,共6页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展规划(批准号:G1999054105);国家高技术研究发展计划(批准号:2001AA223011)资助项目;国际科技合作重点项目(批准号:2001AA223116);北京市科技项目(合同号:H0102-10360119).

摘　　要：不同原核生物在基因组组成上的差异是其生物学性状差异的基础,然而,进化中亲缘关系较近的菌群,其基因组除了含有群或株特异的基因外,还含有反映它们起源和进化痕迹的“共有骨架”结构,而这些“共有骨架”恰恰是它们基本生存能力和共有生物学性状的基础.志贺氏菌在起源和进化上与大肠杆菌极为密切,目前倾向于将二者划为同一个种.利用大肠杆菌K～12全基因组及Sf301特异性ORFs的芯片研究了志贺氏菌4个群间的基因组组成.结果显示,分别有16％～22％K-12的ORFs序列没有在志贺氏菌的基因组中被检测出,而志贺氏菌的基因组中包含至少2800个保守的ORFs,组成了其共有的“共有骨架”.进一步分析提示,这些“共有骨架”是维持肠道细菌正常生命生理活动所必需的基本组成此外,只有20％的Sf301特异性ORFs同时存在于其他3个菌株中,揭示了各菌株间基因组的异质性和菌属内的遗传多样性.

关 键 词：志贺氏菌属 大肠杆菌K-12 全基因组微阵列 骨架序列 

分 类 号：Q933[生物学—微生物学]