丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因2基因组DNA结构分析及其不同剪切体的克隆化研究  

Cloning and identification of NS5ATP2 gene and its spliced variant transactivated by hepatitis C virus non-structural protein 5A

作　　者：杨倩[1] 成军[2] 刘妍[2] 洪源[2] 王建军[2] 张树林[1] 

机构地区：[1]西安交通大学第一医院传染科,陕西省西安市710061 [2]中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室,北京市100039

出　　处：《世界华人消化杂志》2004年第4期801-804,共4页World Chinese Journal of Digestology

基　　金：国家自然科学基金项目;No.C03011402;No.C30070689军队"九;五"科技攻关项目;No.98D063军队回国留学人员启动基金项目;No.98H038军队"十;五"科技攻关青年基金项目;No.01Q138军队"十;五"科技攻关面上项目;No.01MB135~~

摘　　要：目的:HCV NS5A病毒蛋白反式激活作用的新的靶基因NS5ATP2及其不同剪接体基因序列的确立、克隆化研究. 方法:依据我室构建的NS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,利用生物信息学技术获得,提取HepG2 细胞的总RNA,进行反转录(RT-PCR),扩增产物与原核表达载体连接,进行测序鉴定. 结果:经测序鉴定成功获得新基因的编码序列,并意外发现了NS5ATP2的不同剪接体,对NS5ATP2基因组进行分析,获得剪接体的编码序列,并成功进行了克降化研究. 结论:利用分子生物信息学技术,发现并鉴定了HCV NS5A反式激活作用的新的靶基因NS5ATP2(615)及其可变剪接体NS5ATP2(216),为研究新基因的生物学功能及丙肝发病机制提供新的依据.AIM: To clone and identify a new gene NS5ATP2 and its spliced variant transactivated by hepatitis C virus non-structural protein 5A. METHODS: On the base of subtractive cDNA library of genes transactivated by NS5A protein of hepatitis C virus, the coding sequence of new gene and its spliced variant were obtained by bioinformatics methods. Polymerase chain reaction (PCR) was conducted to amplify NS5ATP2 gene. RESULTS: The coding sequence of new gene and its spliced variant were cloned and Identification successfully. CONCLUSION: A novel gene has been recognized as the new target transactivated by HCV NS5A protein. These results bring some new clues for studying the biological functions of the new gene and pathogenesis of the viral proteins.

关 键 词：丙型肝炎病毒 非结构蛋白 NS5A 靶基因 基因差异 DNA结构 剪切体 克隆化 编码序列 

分 类 号：R373.21[医药卫生—病原生物学]