江西省自然科学基金(20114BAB201036)

作品数：9被引量：8H指数：1
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相关期刊：《计算机工程与应用》《中国生物医学工程学报》《计算机应用研究》《半导体光电》更多>>
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基于CUDA的蛋白质点检测快速实现方法被引量：1
《生物医学工程学杂志》2016年第1期83-88,共6页熊邦书 叶毅嘉 欧巧凤 张郝东 
国家自然科学基金资助项目(61163047);江西省自然科学基金资助项目(20114BAB201036);江西省教育厅科技资助项目(GJJ14532);江西省研究生创新专项资金项目资助(YC2013-S219)
为提高蛋白质点检测的效率,利用图像处理单元(GPU)在并行计算和内存管理方面的优势,提出一种基于CUDA的蛋白质点检测快速实现方法。首先,对蛋白质点检测算法中最耗时的图像预处理、蛋白质点粗检测和重叠蛋白质点分割三部分进行并行化设...
关键词：蛋白质点检测 CUDA 并行处理 内存管理 
基于相似度图的凝胶图像间蛋白点特征分析
《中国医学影像学杂志》2015年第10期775-779,784,共6页熊邦书 张郝东 欧巧凤 叶毅嘉 
国家自然科学基金项目(61163047);江西省自然科学基金项目(20114BAB201036);江西省教育厅科技项目(GJJ14532);南昌航空大学江西省图像处理与模式识别重点实验室基金项目(TX201504005);江西省2013年度研究生创新专项资金项目(YC2013-S219)
针对现有凝胶图像间蛋白点匹配方法在选择特征时,没有直观和统一标准的问题,本文提出了基于相似度图的蛋白点特征分析方法。首先给出相似度图的定义和生成方法;其次利用相似度图法分析坐标相似度、形状上下文相似度和形态参数相似度等5...
关键词：凝胶电泳图像 蛋白点匹配 
基于top-hat变换与形状特征的蛋白点检测被引量：1
《计算机工程与应用》2015年第18期224-228,共5页熊邦书 黄周伟 余磊 张郝东 
国家自然科学基金(No.61163047);江西省自然科学基金(No.20114BAB201036);江西省工业支撑计划项目(No.2010GB00405);江西省研究生创新基金(No.YC2013-S219)
针对凝胶图像中蛋白质点检测存在弱蛋白质点漏检和重叠蛋白质点难分离的问题,提出了一种基于top-hat变换与形状特征的弱重叠蛋白质点检测算法。采用top-hat变换算法增强弱蛋白质点区域;采用标记控制分水岭法进行粗检测,提取蛋白质点的...
关键词：凝胶图像 TOP-HAT变换 弱蛋白质点 重叠蛋白质点 形状标记 
基于区域SIFT特征的凝胶图像间蛋白点匹配算法被引量：1
《半导体光电》2015年第1期136-140,共5页熊邦书 黄继昆 欧巧凤 黄周伟 
国家自然科学基金项目(61163047);江西省自然科学基金(20114BAB201036)
针对传统匹配算法对旋转和扭曲图像匹配效果不佳的问题,提出一种基于蛋白点区域SIFT(Sale Invariant Feature Transform)特征的凝胶图像间蛋白点匹配算法。首先,提取蛋白点区域SIFT特征;然后,根据SIFT特征实现蛋白点粗匹配,并采用RANSAC...
关键词：凝胶图像 蛋白点匹配 SIFT特征 TPS变换 
基于2DGE图像先验的蛋白质点检测方法
《半导体光电》2015年第1期145-149,共5页欧巧凤 张会生 熊邦书 李立欣 
国家自然科学基金项目(61163047);江西省自然科学基金项目(20114BAB201036);江西省工业支撑计划项目(2010GB00405)
各种改进的分水岭变换是目前应用最广的二维凝胶电泳(2DGE)图像蛋白质点分割算法。其中标记控制分水岭分割效果较好,但由于忽略了蛋白质点大小和形状,导致外标记落在部分蛋白质点区域内而无法正确分割。针对该问题,提出一种结合2DGE先...
关键词：二维凝胶电泳 图像先验 图像分割 分水岭变换 数据融合 
二维凝胶图像一致蛋白质点集提取方法
《计算机应用研究》2014年第9期2850-2852,共3页欧巧凤 张会生 熊邦书 李立欣 
国家自然科学基金资助项目(61163047);江西省自然科学基金资助项目(20114BAB201036);江西省教育厅科技资助项目(GJJ14532)
针对凝胶图像间蛋白质点人工比对工作量大和易出错的问题,提出一种基于粗配准—精匹配的一致蛋白质点集自动提取方法。根据凝胶图像的SIFT特征匹配结果对凝胶图像进行粗配准;采用标记分水岭方法进行点检测;再根据蛋白质点的距离相似度...
关键词：二维凝胶图像 一致蛋白质点集 SIFT特征 图像配准 
基于灰度分层和几何分块的蛋白质点匹配算法被引量：1
《生物医学工程学杂志》2014年第3期487-492,498,共7页唐浩 熊邦书 欧巧凤 李俊 
国家自然科学基金资助项目(61163047);江西省自然科学基金资助项目(20114BAB201036);江西省工业支撑计划项目资助(2010GB00405)
针对二维电泳凝胶图像匹配过程中,由于图像局部非线性形变导致的伪匹配和漏匹配问题,本文提出了一种结合灰度分层和几何分块的自动匹配算法。首先,依据灰度和几何位置对蛋白质点进行分组,采用形状上下文特征,结合归一化互相关法对蛋白...
关键词：二维电泳凝胶图像 蛋白质点匹配 灰度分层 几何分块 形状上下文 
基于形状特征的重叠蛋白质点分离算法被引量：2
《生物医学工程学杂志》2013年第5期1067-1072,共6页熊邦书 李俊 欧巧凤 唐浩 
国家自然科学基金资助项目(61163047);江西省自然科学基金资助项目(20114BAB201036);江西省工业支撑计划项目资助(2010GB00405)
针对凝胶图像制作过程中会产生蛋白质点重叠和堆聚的问题,提出一种基于形状特征的凝胶图像重叠蛋白质点自动分离算法。首先,采用内外标记分水岭法进行粗检测,提取蛋白质点的初始轮廓;其次,结合极小值深度和形状特征信息自适应设定阈值...
关键词：凝胶图像 重叠蛋白质点分离 分水岭 形状标记 形状距离变换 
基于分层策略的凝胶图像间蛋白点匹配算法被引量：3
《中国生物医学工程学报》2012年第3期422-427,共6页熊邦书 陈乐平 欧巧凤 张超 
国家自然科学基金(61163047);江西省自然科学基金(20114BAB201036);江西省工业支撑计划(2010GB00405)
凝胶图像间蛋白点比对分析是蛋白质组学研究的重要方法,针对凝胶图像间蛋白点人工比对工作量大和易出错等问题,提出一种基于分层策略的凝胶图像间蛋白点自动匹配算法。首先将每张凝胶图像中的蛋白点按不同灰度等级划分到对应层级中;然...
关键词：凝胶图像 蛋白点匹配 分层策略 灰度相关 几何相关 
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