生化反应系统

作品数：35被引量：36H指数：4
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生化反应系统的加速τ-Leap模拟算法
《应用科学学报》2011年第2期203-208,共6页衣娜 庄刚 王翼飞 
国家自然科学基金(No.30971480);国家科技重大专项基金(No.2009ZX09103-686);上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101);上海市重点学科建设项目基金(No.S30104)资助
该文重新定义了临界反应,以更合理地界定可能出现负分子组分的反应.在此基础上提出了加速τ-leap算法,使系统中某些反应物数目较少时也可以采用τ-leap方法进行模拟,同时提高了模拟速度.以两个生化反应系统模型为例,分别用精确的随机模...
关键词：步长选择策略 临界反应 τ-leap算法 随机模拟算法 生化反应系统 
改进的τ-leap算法在生化反应系统随机模拟中的应用被引量：3
《应用科学学报》2009年第3期266-271,共6页刘焕 彭新俊 周文 王翼飞 
国家自然科学基金(N0.30871341);国家"863"高技术研究发展计划基金(No.2006AA02Z190)项目
提出了一种τ-选择策略,有效地反映了生化反应系统中分子数目的改变.并由此提出了改进的τ-leap(improvedτ-leap)算法,该算法对生化反应系统的随机模拟更为有效和实用.并以两个生化反应系统模型为例,分别用精确的SSA算法、改进的τ-lea...
关键词：随机模拟算法 τ-选择策略 τ-leap算法 生化反应系统 
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