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作品数:144被引量:290H指数:11
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相关领域:生物学医药卫生更多>>
相关作者:张效伟杨江华肖能文李晨虹王伟继更多>>
相关机构:上海海洋大学中国科学院浙江海洋大学西南大学更多>>
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相关基金:国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金国家重点基础研究发展计划更多>>
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eDNA监测测序数据分析注释中参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备的影响——以长江中游鱼类为监测目标
《湖泊科学》2024年第6期1843-1852,共10页许兰馨 杨海乐 刘志刚 杜浩 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(YFI202201);农业财政专项“长江禁捕后常态化监测专项”(CJJC-2023-01)联合资助。
在基于宏条形码(meta-barcoding)的eDNA监测技术中,eDNA测序数据的分析和注释是决定监测结果判断和评估精准与否的基础,而参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备是eDNA测序数据分析和注释中最为关键的3个技术环节。为厘清上述3个...
关键词:环境DNA 鱼类 宏条形码 参考数据库 OTU聚类序列相似度 物种注释分类置信度 长江中游 
eDNA监测空间分辨率量化方法研究——以长江中游干流平水期为案例被引量:1
《长江流域资源与环境》2024年第4期855-869,共15页杨海乐 许兰馨 周琼 刘志刚 吴金明 
中国水产科学研究院长江水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(YFI202201)。
eDNA监测技术有助于提高水生生物种类组成监测和种群健康监测的效率,而eDNA监测的空间分辨率未量化阻碍了常态化系统化eDNA监测的实施。为了量化eDNA监测的空间分辨率,探索建立了一个基于流域生物信息流分析框架和eDNA监测空间分辨率概...
关键词:环境DNA监测 空间分辨率 可信度与覆盖度 流域生物信息流 流域生态学 
大型河流中鱼类组成的eDNA监测效率:以长江武汉江段为例被引量:17
《中国水产科学》2021年第6期796-807,共12页杨海乐 吴金明 张辉 杜浩 李君轶 王成友 沈丽 刘志刚 危起伟 
农业农村部财政专项(CJDC-2017-14);中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020JBF01);中国水产科学研究院基本科研业务费创新团队项目(2020TD08)。
为了探讨大型河流中的eDNA监测效率,以长江为大型河流的代表,以鱼类为水生生物的代表,分析传统捕捞监测和eDNA监测结果的差异,研究eDNA监测技术对长江武汉江段鱼类组成的监测能力、监测效率、平行样设置等问题。结果显示:(1)用1对eDNA...
关键词:长江 鱼类 种类组成 eDNA宏条形码 eDNA监测 监测效率 
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