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作品数：144被引量：290H指数：11
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相关领域：生物学医药卫生更多>>
相关作者：张效伟杨江华肖能文李晨虹王伟继更多>>
相关机构：上海海洋大学中国科学院浙江海洋大学西南大学更多>>
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eDNA监测测序数据分析注释中参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备的影响——以长江中游鱼类为监测目标
《湖泊科学》2024年第6期1843-1852,共10页许兰馨 杨海乐 刘志刚 杜浩 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(YFI202201);农业财政专项“长江禁捕后常态化监测专项”(CJJC-2023-01)联合资助。
在基于宏条形码(meta-barcoding)的eDNA监测技术中,eDNA测序数据的分析和注释是决定监测结果判断和评估精准与否的基础,而参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备是eDNA测序数据分析和注释中最为关键的3个技术环节。为厘清上述3个...
关键词：环境DNA 鱼类 宏条形码 参考数据库 OTU聚类序列相似度 物种注释分类置信度 长江中游 
eDNA监测方法标准化框架及未来图景被引量：11
《湖泊科学》2023年第1期12-31,共20页杨海乐 张辉 杜浩 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2021JC01,YFI202201)资助。
eDNA(environmental DNA)是指从环境样品(水体、土壤、沉积物、空气、混合物等)中提取的DNA,是各种生物的DNA混合物,区别于传统从单物种样品中提取的DNA。eDNA监测是指从环境样品中提取DNA,用物种特异性引物或特定DNA metabarcoding引...
关键词：环境DNA 生物信息 生物多样性监测 标准化 
大型河流中鱼类组成的eDNA监测效率:以长江武汉江段为例被引量：17
《中国水产科学》2021年第6期796-807,共12页杨海乐 吴金明 张辉 杜浩 李君轶 王成友 沈丽 刘志刚 危起伟 
农业农村部财政专项(CJDC-2017-14);中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020JBF01);中国水产科学研究院基本科研业务费创新团队项目(2020TD08)。
为了探讨大型河流中的eDNA监测效率,以长江为大型河流的代表,以鱼类为水生生物的代表,分析传统捕捞监测和eDNA监测结果的差异,研究eDNA监测技术对长江武汉江段鱼类组成的监测能力、监测效率、平行样设置等问题。结果显示:(1)用1对eDNA...
关键词：长江 鱼类 种类组成 eDNA宏条形码 eDNA监测 监测效率 
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