GWAS

作品数：458被引量：1194H指数：18
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主流生物芯片GWAS catalog癌症相关基因突变检出分析
《癌症进展》2017年第10期1139-1141,1149,共4页杨兴礼 付永全 陶涛 刘小军 
国家科技支撑计划项目课题(2015BAH09F03)
目的比较二代测序方法和主流芯片检测已知疾病相关SNP特别是癌症相关SNP检出率的差异。方法下载GWAS catalog和23and Me、Human Omni5、Genome Wide SNP6、Human Exome12等主流生物芯片的检测突变数据集和进行基因型填充之后的突变数据...
关键词：二代测序 生物芯片 分子诊断 生物信息 癌症 
基于GWAS后分析策略研究TRAPPC9基因对奶牛产奶性状的遗传效应被引量：5
《畜牧兽医学报》2015年第1期60-68,共9页董易春 刘超 王晓 王雅春 张毅 孙东晓 张胜利 张勤 张沅 俞英 
国家自然科学基金(31272420);农业部奶业体系项目(CARS-37-04B);十二五国家科技支持项目(2011BAD28B02);"863"重大项目(2008AA101002);教育部基本科研项目(2011JS006);长江学者与创新团队发展计划(IRT1191)
本研究基于课题组前期对北京地区中国荷斯坦牛群体产奶性状全基因组关联分析结果,在新的中国荷斯坦牛群中将转运蛋白颗粒复合体9(TRAPPC9)基因作为产奶性状的候选基因进行遗传效应验证。研究利用混池测序寻找SNPs位点,结合前期GWAS结果...
关键词：产奶性状 TRAPPC9基因 SNP DNA甲基化 
A post-GWAS replication study confirming the association of C14H8orf33 gene with milk production traits in dairy cattle
《Frontiers of Agricultural Science and Engineering》2014年第4期321-330,共10页Shaohua YANG Chao QI Yan XIE Xiaogang CUI Yahui GAO Jianping JIANG Li JIANG Shengli ZHANG Qin ZHANG Dongxiao SUN 
supported by the National High-tech R&D Program of China(2013AA102504);the National Key Technology R&D Program(2011BAD28B02);the National Transgenic Major Project(2014ZX08009-053B);the Beijing Innovation Team of Technology System in the National Dairy Industry,the Beijing Research and Technology Program(D121100003312001);the earmarked fund for Modern Agro-industry Technology Research System(CARS-37);the Program for Changjiang Scholar and Innovation Research Team in University(IRT1191).
Genome-wide association studies with an Illumina Bovine50K chip have detected 105 SNPs associated with one or multiple milk production traits in the Chinese Holstein population.Of these,38 significant SNPs detected wi...
关键词：GWAS functional annotation Chinese Holstein milk production traits C14H8orf33 gene single nucleotide polymorphisms association study 
Genome-Wide Association Study for Certain Carcass Traits and Organ Weights in a Large White×Minzhu Intercross Porcine Population被引量：5
《Journal of Integrative Agriculture》2014年第12期2721-2730,共10页LIU Xin WANG Li-gang LIANG Jing YAN Hua ZHAO Ke-bin LI Na ZHANG Long-chao WANG Li-xian 
supported by the Agricultural Science and Technology Innovation Program, China (ASTIPIAS02);the National Key Technology R&D Program of China (2011BAD28B01);the National Natural Science Foundation of China (31201781);the Earmarked Fund for Modern Agroindustry Technology Research System, National Technology Program of China (2011ZX08006-003);the Chinese Academy of Agricultural Sciences Foundation (2011cj-5, 2012ZL069 and 2014ywf-yb-8)
Porcine carcass traits and organ weights have important economic roles in the swine industry. A total of 576 animals from a Large White×Minzhu intercross population were genotyped using the Illumina PorcineSNP60K Bea...
关键词：genome-wide association study （GWAS） carcass trait HMGA1 gene organ weight PIG 
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