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肿瘤干细胞特征及干性指数机器算法的研究进展被引量：1
《中华肿瘤防治杂志》2022年第17期1300-1304,共5页李文洁 殷旻皓 钱海声 陈哲 李璇 张国新 
国家自然科学基金(81970499,81770561);江苏省医学创新团队项目(CXTDA2017033)
目的就肿瘤干细胞特征及肿瘤干性指数相关算法进行综述,以期更好地指导肿瘤患者的精准化治疗,从而改善肿瘤患者预后。方法以“cancer stem cell、stemness index、stemness characteristics、machine algorithm、OCLR、ssGSEA、REOs”...
关键词：肿瘤干细胞 干性指数 干性特征 机器算法 
MAD2L1/CAMK2A/PTTG1基因簇失调维持子宫内膜癌干性特征被引量：2
《中国医学科学院学报》2021年第5期685-695,共11页郑菁 张轶雯 潘宗富 
国家自然科学基金(81802673);浙江省自然科学基金(LQ18H160017)。
目的研究子宫内膜癌(UCEC)的干性特征及潜在调控机制。方法从癌症基因组图谱数据库中获取UCEC转录组测序数据。在R3.5.1环境下,采用edgeR包对基因表达谱进行标准化。基于一类逻辑回归机器学习算法计算各UCEC样本的mRNA干性指数(mRNAsi)...
关键词：子宫内膜癌 肿瘤干细胞 干性指数 生物标志物 共表达网络 
恶性肿瘤干性及其量化分析方法的研究进展被引量：1
《中国细胞生物学学报》2023年第3期443-451,共9页孙学梦 刘芳远 苏丽娅 
国家自然科学基金(批准号:81860541);内蒙古自治区高等学校科学研究项目(批准号:NJZY22674);内蒙古医科大学致远人才计划(批准号:ZY0120025);内蒙古医科大学青年创新基金(批准号:YKD2020QNCX028)资助的课题。
一直以来,肿瘤干细胞一直是恶性肿瘤研究领域的重要研究靶点之一,其干性特征影响了癌症的发生、治疗抵抗和复发。传统的肿瘤干性机制研究需要实验流式技术对肿瘤干细胞进行分选和提取。二代测序技术在肿瘤研究领域的普及产生了大量的肿...
关键词：肿瘤干细胞 干性指数 测序 算法 预后 
基于加权基因共表达网络探索喉癌干性关键基因
《数理医药学杂志》2024年第3期171-179,共9页昝雨欣 丁妍 
目的采用肿瘤干性指数mRNAsi筛选喉癌相关基因,为喉癌相关研究提供新思路。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载喉癌mRNA表达谱,采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,W...
关键词：喉癌 肿瘤干细胞 干性指数 免疫 加权基因共表达网络分析 
利用加权基因共表网络识别肝细胞癌干细胞相关基因的研究被引量：3
《中国普外基础与临床杂志》2020年第5期560-568,共9页徐贺龙 李燕 任程晖 宋晓静 张磊 李汛 
国家自然科学基金面上项目(项目编号:31570509);甘肃省科技重大专项项目(项目编号:1602FKDA001);甘肃省卫生行业计划项目(项目编号:GSWSKY2016-27)。
目的通过加权基因共表达网络(WGCNA)方法研究肝细胞癌(HCC)中肝癌干细胞(LSCS)相关基因表达及其与预后的相关性。方法首先从公共数据库癌症基因组图谱(TCGA)中下载HCC转录组测序(RNA-seq)及临床数据,下载并整理基于mRNA表达的肿瘤干细...
关键词：肝细胞癌 肿瘤干细胞 加权基因共表达网络分析 干性指数 癌症基因组图谱 
基于干性指数模型对肉瘤预后、免疫浸润和铁死亡调控的分析
《中国组织工程研究》2025年第19期4151-4160,共10页魏婧娴 孟莲 孙皓 张田田 刘春霞 
国家自然科学基金项目(81960485),项目负责人:刘春霞;国家自然科学基金项目(82060487),项目负责人:孟莲;2022年广州市科技计划市校联合项目(202201020104),项目负责人:刘春霞。
背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测...
关键词：肉瘤 干细胞 干性指数 铁死亡 生存预后 免疫浸润 
基于TCGA数据库探索舌癌干细胞关键基因的表达及其意义被引量：1
《右江民族医学院学报》2023年第1期92-98,共7页王珊 欧明煜 符蓉 张钊银 王洪伟 姚金光 
国家自然科学基金项目(81660495)。
目的通过生物信息学方法研究舌癌中干细胞相关的关键基因,并利用关键基因的生物学作用和功能富集初步探索舌癌干细胞关键基因的功能。方法舌癌RNA-seq数据和相关临床信息从癌症基因组图谱(TCGA)下载。利用R语言分析舌癌病例,WGCNA用于...
关键词：舌肿瘤 肿瘤干细胞 干性指数 
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