基于 TCGA 数据库筛选肝癌 miRNA 生物标志物及  

作　　者：杜秀芳 刘军杰[2] 黄奕铭 张春燕[1] 

机构地区：[1]广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部,广西南宁530000 [2]广西医科大学附属肿瘤医院超声科,广西南宁530021 [3]广西医科大学基因组与个体化医学实验中心,广西南宁530021

出　　处：《医药界》2019年第5期0014-0015,共2页

基　　金：基金项目:广西科技计划项目重点研发计划(桂科 AB18126032) 广西自然科学基金项目(2016GXNSFBA380194).

摘　　要：目的 基于 The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库中肝细胞肝癌(肝癌)相关微小 RNA(miRNA)及 mRNA 的生物学分析,探索肝癌相关异 常表达的 miRNA 生物标志物及其靶基因功能和调控的信号通路。方法 利用 TCGA 数据库中的肝癌组织和正常组织样本数据进行对比分析,筛选出来差异 表达的 miRNA 和 mRNA;通过对 miRNA 潜在靶基因的筛选和与差异表达的 mRNA 取交集,进一步对 miRNA 进行筛选;对 miRNA 的靶基因进行 Gene Ontology(GO)功能和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路富集分析。结果 筛选得到 7 个差异表达 miRNA,其中 5 个上调 miRNA: hsa-mir-532、hsa-mir-21、hsa-mir-93、hsa-mir-103a-2 和 hsa-mir-103a-1;2 个下调 miRNA:hsa-mir-511 和 hsa-mir-424;通过预测靶基因并与差异表达的 mRNA 取交集,上调 miRNA 有 16 个靶基因,下调 miRNA 有 2 个靶基因;KEGG 信号通路和 GO 功能分析结果表明,上调的 miRNA 靶基因主要富集在“Glioma” 通路,与“response to hormone stimulus”、“response to endogenous stimulus”和“regulation of cell morphogenesis”等功能相关。结论 差异表达的 miRNA 对肝癌发 生发展具有一定的影响,有可能作为诊断肝癌的生物标志物和治疗靶点应用于临床。

关 键 词：肝癌 MIRNA 生物标志物 生物信息学 

分 类 号：R73[医药卫生—肿瘤]