胃癌基因表达谱的生物信息学分析  

作　　者：魏汝玉 

机构地区：[1]聊城市东昌府人民医院,山东聊城252000

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2021年第3期13-13,16,共2页

摘　　要：胃癌(STAD)是一种预后差、治疗选择有限的疾病。这项研究旨在探索基因表达谱;调查潜在的机制并确定胃癌新靶点。我们分析了来自;Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的两个微阵列数据集(GSE64951和GSE54129)。使用GEO2R工具筛选胃癌和正常样品之间差异表达基因(DEGs)。利用基因本体(GeneOntology GO)功能和《京都基因与基因组百科全书》(KyotoEncyclopedia ofGenes and Genomes KEGG)通路的富集分析;对差异基因的通路和功能进行识别。然后;使用;STRING;和;Cytoscape;构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;以鉴定关键基因。通过构建;PPI 网络和 Venn 图,筛选出:ITGB1、FGF7、ZEB1、LOX、FBXW7、ESRP1、PTPN11、DICER1和NES等9个连接度较高的核心基因。我们研究进一步发现,ITGB1对胃癌预后有显着影响。本研究中所发现的新的差异基因和分子通路可能为研究胃癌在分子水平上的潜在机制提供新的思路。

关 键 词：胃癌 差异表达基因 GO 和 KEGG 富集 关键基因 ITGB1 

分 类 号：R473[医药卫生—护理学]