关键基因

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机器学习联合生物信息学筛选与自噬相关的肺纤维化关键基因及实验验证
《中国组织工程研究》2025年第35期7679-7689,共11页巩月红 王梦君 任航 郑辉 孙佳佳 刘军鹏 张飞 杨建华 胡君萍 
新疆维吾尔自治区卫生健康委员会“天山英才”医药卫生高层次人才培养计划项目(TSYC202301B095),项目负责人:巩月红;新疆维吾尔自治区大学生创新训练计划项目(S202310760059),项目负责人:王梦君;新疆维吾尔自治区科学技术厅自然科学基金重点项目(2021D01D11),项目负责人:胡君萍;新疆医科大学第一附属医院创新团队培养项目(党字[2023]52号),项目负责人:杨建华。
背景:肺纤维化的早期诊断是及时开展抗纤维化药物治疗的基础,因此,探索并发现能够有效应用于肺纤维化早期诊断的理想生物标志物对疾病治疗至关重要。目的:通过生物信息学和机器学习技术对肺纤维化过程中涉及的与自噬相关关键基因进行深...
关键词：肺纤维化 自噬 机器学习 生物信息学 免疫浸润 最小绝对收缩与选择算子 基因富集分析 工程化组织构建 
线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制
《中国组织工程研究》2025年第31期6708-6716,共9页谢铱子 林雪莹 张欣欣 黄秀芳 詹少锋 江勇 蔡彦 
广东省中医院珠海医院呼吸疾病区域诊疗中心培育建设项目,项目负责人:蔡彦;广东省中医院中医药科学技术研究专项(YN2023MS09),项目负责人:蔡彦;第二届广东省中医院优秀中医临床人才研修项目[中医二院(2024)88号],项目负责人:蔡彦;深圳市“医疗卫生三名工程”建设项目(SZZYSM202206013);广东省重点科室(中西医协同科室)建设项目,项目负责人:江勇;国家中医优势专科建设项目(广州中医药大学第一附属医院肺病科),项目负责人:詹少锋。
背景:线粒体自噬与特发性肺纤维化的发生发展关系密切,但其作用机制尚不清楚。目的:探讨线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制,为临床特发性肺纤维化风险预测及亚型区分提供思路。方法:通过GEO和Reactome Pathway数据库等获取特发...
关键词：特发性肺纤维化 线粒体自噬 自噬关键基因 亚型分析 富集分析 免疫浸润分析 肺功能 生物信息学 
激素性股骨头坏死衰老关键基因的生物信息学鉴定和验证
《中国组织工程研究》2025年第26期5608-5620,共13页丘博元 刘飞 童思文 欧志学 王伟伟 
广西中医药大学研究生教育创新计划项目(YCSY2023067),项目负责人:丘博元;广西自然科学基金项目(2023GXNSFAA026412),项目负责人:欧志学;广西壮族自治区中医药管理局自筹经费科研课题(GXZYZ20210372),项目负责人:欧志学。
背景:激素性股骨头坏死与衰老紧密相连,但调控靶点和机制尚不明确。通过生物信息学联合机器学习分析并加以实验验证,确定细胞衰老介导激素性股骨头坏死发生发展的关键基因,将为激素性股骨头坏死的防治提供新思路。目的:使用生物信息学...
关键词：激素性股骨头坏死 衰老 WGCNA分析 机器学习 免疫浸润分析 实验验证 
骨关节炎内质网应激关键基因的生物信息学筛选及实验验证
《中国组织工程研究》2025年第26期5632-5641,共10页郝茂辰 马超 刘凯 柳可心 孟令婷 王杏如 王建忠 
内蒙古自治区第三批首府地区公立医院高水平临床专科建设科技项目(2023SGGZ143),项目负责人:王建忠;内蒙古医科大学重点项目(YKD2024ZD005),项目负责人:王建忠;内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目(YKD2023ZY001),项目负责人:刘凯;内蒙古自治区研究生科研创新项目(S20231189Z),项目负责人:刘凯。
背景:内质网应激和骨关节炎的发生、发展密切相关,但其关键基因及调控机制尚不明确。目的:基于生物信息学筛选骨关节炎内质网应激关键基因,并加以细胞模型实验验证,以期从内质网应激角度为防治骨关节炎提供新策略。方法:从GEO数据库下...
关键词：骨关节炎 内质网应激 WGCNA 机器学习 人滑膜细胞 免疫浸润分析 生物标志物 实验验证 细胞实验 差异基因 
基于加权基因共表达网络分析探讨急性胰腺炎相关脓毒症潜在的关键基因
《安徽医药》2025年第5期940-944,I0002,I0003,I0004,共8页桑珍珍 冯顺易 李勇 
河北省科技厅医学科学研究重点计划项目(182777156)。
目的旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因。方法2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集。采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因。采用R软件筛选出急性胰腺炎和...
关键词：急性胰腺炎 脓毒症 关键基因 加权基因共表达网络分析 基因本体论 
基于WGCNA分析系统性红斑狼疮的关键基因
《齐齐哈尔医学院学报》2025年第7期607-612,共6页张琳萄 陈春丽 崔道林 
云南省教育厅科学研究基金项目(2023J1760)。
目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法,筛选与系统性红斑狼疮(SLE)相关的高风险致病基因及其潜在的生物学过程和信号通路,以为SLE的发生、发展及其发病机制提供理论依据。方法 从GEO数据库中下载GSE72326基因表达数据集,利用R语...
关键词：系统性红斑狼疮 生物信息学 关键基因 
基于免疫检查点抑制剂治疗效果的膀胱癌关键基因分析
《现代泌尿生殖肿瘤杂志》2025年第2期96-100,共5页张春雷 王东星 李莎 
甘肃省自然科学基金资助(21JR11RA015)。
目的 筛选与膀胱癌免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗效果相关的关键基因。方法利用生物信息学方法,获取IMvigor 210数据集中同时与ICIs治疗效果及总生存率(OS)相关的基因,利用这些基因将癌症基因组图谱(TCGA)数据库中膀胱癌患者进行亚组分型...
关键词：膀胱癌 免疫检查点抑制剂 关键基因 
前列腺癌关键基因的生物信息学分析
《甘肃科学学报》2025年第2期123-131,共9页周志刚 高焱平 宋勇波 
前列腺癌(PCa)是常见的恶性肿瘤,已成为严重影响我国男性健康的疾病。然而,目前PCa发病的分子机制仍不清楚,且缺少有效的药物治疗。研究通过生物信息学技术和方法探索PCa发生和预后的关键基因,为临床诊断及治疗、疾病预后预测提供新的...
关键词：前列腺癌 生物信息学 基因表达 GLEASON评分 
转录组和代谢组联合分析挖掘灰毡毛忍冬苯丙素类物质生物合成途径关键基因
《中国实验方剂学杂志》2025年第8期167-175,共9页何佳蔚 张惊宇 曾娟 朱佳源 周思敏 瞿美玲 周日宝 刘湘丹 
国家自然科学基金项目(82373992);国家现代农业产业技术体系(CARS-21);湖南省中药材产业技术体系专项(HARS-11);湖南省自然科学基金项目(2023JJ60477);2020年湖南省一流专业建设点:中药资源与开发;湖南中医药大学重点学科中药学科(校行发规字【2023】2号);湖南中医药大学研究生创新课题项目(2024CX094);湖南中医药大学校级科研基金项目(2022YYZK003);湖南中医药大学本科生科研创新基金项目(2023BKS102);湖南省研究生科研创新项目(CX20230803)。
目的:基于转录组和代谢组联合分析挖掘灰毡毛忍冬中苯丙素类化合物生物合成途径关键基因,为进一步探究湘蕾型灰毡毛忍冬中苯丙素类化合物的合成调控机制提供基础。方法:选取湘蕾型灰毡毛忍冬茎、叶和3个花期花作为实验材料构建转录组和...
关键词：灰毡毛忍冬 苯丙素类化合物 转录组 代谢组 联合分析 关键基因 
基于单细胞核测序的共表达网络分析人静脉畸形发生与侵袭相关的内皮细胞关键基因
《中华预防医学杂志》2025年第4期458-467,共10页刘文博 林俊杰 张媚娟 苑春杰 冯小娟 焦文婷 乔军波 王雯秋 方斌 陈长宽 
河南省重点研发专项(231111311400)。
目的利用生物信息学分析筛选内皮细胞(endothelial cell,EC)中与人静脉畸形(venous malformations,VMs)发生、侵袭相关的关键基因,为VMs早期筛查和靶向干预提供依据。方法采用病例对照研究方法,收集2021年9月至2023年9月郑州大学第三附...
关键词：静脉畸形 单细胞核转录组测序 高维加权基因共表达网络分析 关键基因 
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