基因本体论

作品数：63被引量：133H指数：6
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基于加权基因共表达网络分析探讨急性胰腺炎相关脓毒症潜在的关键基因
《安徽医药》2025年第5期940-944,I0002,I0003,I0004,共8页桑珍珍 冯顺易 李勇 
河北省科技厅医学科学研究重点计划项目(182777156)。
目的旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因。方法2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集。采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因。采用R软件筛选出急性胰腺炎和...
关键词：急性胰腺炎 脓毒症 关键基因 加权基因共表达网络分析 基因本体论 
艾塞那肽改善糖尿病小鼠症状的核心基因探究
《生物技术》2024年第6期707-714,787,共9页程优 刘影 房敬尧 甄若楠 朱黎娜 牛文彦 
国家自然科学基金面上项目(82270856);天津市医学重点学科(专科)建设项目(TJYXZDXK-032A);天津医科大学朱宪彝纪念医院科研基金资助项目(2019ZDKF08,ZXY-YJJ2021-3);天津中医药大学第二附属医院科研基金资助项目(QMJH202122)。
[目的]探究艾塞那肽治疗糖尿病的机制和靶基因。[方法]下载数据集筛选差异表达基因,构建疗效相关的共表达网络筛选加权基因,选取两组数据交集基因并使用蛋白互作网络确立核心基因,使用糖尿病模型小鼠验证核心基因。[结果]共获取15个交...
关键词：艾塞那肽 2型糖尿病 生物信息学 枢纽基因 血清和糖皮质激素诱导的激酶-1 加权基因共表达网络分析 基因本体论 差异表达基因 
基于GEO和TCGA数据库分析胃癌发生发展关键靶点的研究
《继续医学教育》2024年第8期188-192,共5页张思淼 任丽莉 
2020年辽宁省教育厅科学研究经费项目(JYTJCZ R2020075)。
目的阐明胃癌(gastric cancer,GC)组织与癌旁组织之间的基因表达差异,并评估其预后价值。方法从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中选取3个GC微阵列数据集(GSE79973、GSE54129和GSE19826),limma包分析GC和癌旁组织间基...
关键词：胃癌 GEO数据库 TCGA数据库 基因本体论 京都基因与基因组百科全书 
基于生物信息学的蛋白质功能预测方法研究进展被引量：5
《生物工程学报》2024年第7期2087-2099,共13页何新媛 刘杨 曾祥荷 高荣凤 田真 樊祥宇 
国家自然科学基金(31600148);山东省自然科学基金(ZR2021MC018)。
随着计算能力的增加和生物数据的快速扩展,利用生物信息学解决一些生物学问题逐渐成为主流的解决方案。蛋白质功能预测是生物医学和药物研究领域的重要任务。利用生物信息学进行蛋白质功能预测成为研究热点。本文将基于生物信息学的蛋...
关键词：生物信息学 蛋白质功能预测 基因本体论 机器学习 深度学习 
基于网络药理学和分子对接探讨桑椹治疗糖尿病肾病作用机制
《中国中医药图书情报杂志》2024年第3期37-44,共8页刘方正 李季生 王彬彬 范伟 李娜 董现玲 
河北省在读研究生创新能力培养项目(CXZZSS2023139);河北省重点研发计划(20326336D)。
目的运用网络药理学和分子对接方法探讨桑椹治疗糖尿病肾病潜在作用机制。方法检索TCMSP数据库获取桑椹活性成分及作用靶点,检索DisGeNET、DrugBank、GeneCards、TTD数据库获取糖尿病肾病相关靶点,将两者靶点的交集作为桑椹治疗糖尿病...
关键词：桑椹 糖尿病肾病 网络药理学 分子对接 基因本体论 
静脉注射利多卡因后差异蛋白质的蛋白质组学分析
《宁夏医科大学学报》2024年第6期571-576,共6页李翔 张永海 杨凡 张玉 杨万吉 高冉 文岳 马少玲 马汉祥 
宁夏自然科学基金项目(2021AAC03341)。
目的利用蛋白质组学技术定量分析静脉注射利多卡因(IVL)前后血清中差异蛋白质的表达。方法选取健康志愿者5例,IVL 1.5 mg·kg^(-1)后再以3 mg·(kg·h)^(-1)持续泵注30 min。IVL前和IVL后1 h各采集静脉血5 mL,通过串联质谱标记及高效液...
关键词：差异蛋白 基因本体论 富集分析 串联质谱标签 利多卡因 
二代测序结合生物信息分析技术测定绝经后骨质疏松症病人血清外泌体来源相关miRNA的临床意义
《蚌埠医学院学报》2023年第12期1670-1675,共6页徐靖泽 朱成鑫 陈绪鲲 储佳奇 邵松 
安徽省卫健委项目(AHWJ2021b118);安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2021ZD0035)
目的研究血清外泌体来源microRNA(miRNA)作为预测绝经期女性骨质疏松症的潜在生物标志物。方法检测65岁以上骨质疏松症女性病人和健康对照者血清中的miRNA。RNA测序用于鉴定差异表达的miRNA。使用TargetScan、PicTar和miRanda数据库预...
关键词：骨质疏松症 二代测序 MICRORNA 基因本体论 京都基因与基因组百科全书 
多重生物信息学分析慢加急性肝衰竭关键基因及其调控网络
《医学研究杂志》2023年第12期83-88,共6页王秀峰 陈桂容 林华明 
广西自然科学基金资助项目(2018GXNSFBA281031);广西自然科学基金创新研究团队项目(2018GXNSFGA281002)。
目的通过多重生物信息学筛选慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)关键基因及通路,为ACLF分子生物学研究和生物学标志物筛选提供理论依据。方法首先从基因表达数据集(Gene Expression Omnibus,GEO)下载ACLF转录组mRNA...
关键词：慢加急性肝衰竭 生物信息学 GEO数据库 差异表达基因 基因本体论 京都基因与基因组百科全书 
基于网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊治疗结直肠癌作用机制
《南昌大学学报（医学版）》2023年第3期5-11,17,共8页杨从影 罗江 唐莉华 黄学娣 孙龙华 
江西省卫健委科技计划(202211480)。
目的通过网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊(LQC)治疗结直肠癌(CRC)的分子作用机制。方法从中药系统药理学数据库(TCMSP)获取LQC有效成分及靶蛋白数据,从OMIM、TTD、GeneCards数据库获取CRC相关靶点数据,比对得到交集靶点并用STRING数...
关键词：灵芪胶囊 直结肠癌 基因本体论 分子对接 网络药理学 
深度学习在蛋白质功能预测中的应用被引量：3
《合成生物学》2023年第3期488-506,共19页宋益东 袁乾沐 杨跃东 
国家重点研发计划(2022YF1203100);国家自然科学基金(12126610)。
蛋白质功能预测是生物信息学中的一项重要任务,在疾病机制的阐明和药物靶点发现等领域有着重要作用。因为传统的测定蛋白质功能的生化实验通常成本高、耗时长、通量低,所以开发出高效且准确的蛋白质功能预测计算方法十分重要。蛋白质功...
关键词：深度学习 蛋白质 功能预测 结合位点 基因本体论 
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