LncRNA CDKN2B-AS1与HCV相关肝癌发展关联分析  

作　　者：张永峰[1] 黄鹏 陈红波[1] 张美玲 王一凡[1] 

机构地区：[1]句容市人民医院感染性疾病科,江苏镇江212400 [2]南京医科大学公卫预防医学,江苏南京210000

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2022年第1期1-4,共4页

摘　　要：利用生物信息学分析识别丙型肝炎相关肝癌患者和正常对照人群的差异表达lncRNA,并寻找潜在的生物标记物。方法:从GEO数据库搜索并下载数据集,通过R的limma包对18407个mRNA(截止2021年12月)进行差异表达基因的分析识别。对这些差异表达的lncRNA进行富集分析,选出前十个关键基因集,并构建ceRNA网络。使用GEO数据库下载包含不同阶段样本基因表达量的数据集,探讨上述ceRNA中的lncRNA及其调控的mRNA在不同阶段病变中表达变化情况。结果:共筛选出38个在HCV-HCC组中差异表达的lncRNA,其中26个表达显著升高,12个显著降低。差异表达基因主要富集在Panobinostat、Topotecan等药物信号通路,以及乳腺癌、淋巴瘤、肺癌等癌症信号通路。lncRNA CDKN2B-AS1在高级别发育不良组表达量最高,其调控的mRNA大多数都显示了在不同阶段的HCC组别中都有一定的表达量,且在较晚期HCC组中表达量显著上调。结论:CDKN2B-AS1可能作为丙型肝炎相关肝癌发生发展的标记物。

关 键 词：丙肝 肝细胞癌 lncRNA 生物信息学 

分 类 号：R739.41[医药卫生—肿瘤]