关于生物信息学技术筛选圆锥角膜相关致病基因及其通路  

作　　者：杨笑龙 王芸[2] 徐悦[2] 张晓峰[2] 

机构地区：[1]苏州大学附属第一医院,江苏苏州215000 [2]苏州大学附属独墅湖医院,江苏苏州215000

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2022年第7期133-137,共5页

摘　　要：针对圆锥角膜的患者行全外显子测序结果,筛选与圆锥角膜相关的候选致病基因。方法 收集就诊于苏州大学附属第一医院眼科圆锥角膜患者外周血,行全外显子测序。使用dbSNP、千人数据库、外显子、数据库、HGMD、Clinvar和OMIM数据库排除已知突变。利用SIFT、PolyPhen2和Mutation Taster预测基因突变的危害性,同时进行信号通路分析和GO注释。鉴定与圆锥角膜密切相关的基因以及通路。结果 共纳入20例圆锥角膜患者,其中原发性圆锥角膜17人(男性12人,女性5人),LASIK术后继发性圆锥角膜3人(男性3人)。研究共筛选出41个疑似致病基因。对疑似致病基因进行通路富集分析发现,多集中在角膜损伤修复、角膜增殖、角膜神经再生等通路上。继发性圆锥角膜中最终筛选出WEE1为最终致病基因。Notch信号通路可能是圆锥角膜发病的关键通路。结论 所筛选的疑似致病基因参与了圆锥角膜发生发展,可能成为圆锥角膜早期诊断生物标志物。

关 键 词：生物信息学 圆锥角膜 全外显子测序 

分 类 号：R772.2[医药卫生—眼科]