基于GEO数据库与网络药理学探讨文冠果壳苷抗阿尔兹海默症的作用机制  

作　　者：向万舫 潘晓婧[1] 蔡明钦 王敏[2] 

机构地区：[1]兰州大学口腔医学院,甘肃兰州730000 [2]兰州大学基础医学院,甘肃兰州730000

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2023年第8期78-84,共7页

摘　　要：利用GEO数据挖掘技术、网络药理学和分子对接技术,深入探究文冠果壳苷在治疗阿尔兹海默症中的作用机制。方法 通过Pharmmaper、SEA数据平台获取文冠果壳苷的生物功能作用靶点;通过R软件limma包对GEO平台阿尔兹海默症数据集GSE138260进行差异基因筛选;构建文冠果壳苷作用靶点与疾病相关靶点韦恩图,筛选文冠果壳苷治疗阿尔兹海默症的潜在作用靶点;利用Cytoscape软件及STRING数据库构建“关键靶点-通路”网络图、蛋白相互作用(PPI)网络图;借助R语言对潜在靶点进行GO和KEGG富集分析;利用PyMOL软件对文冠果壳苷与核心靶点间进行分子对接。结果 共获得文冠果壳苷作用靶点228个,阿尔兹海默症基因芯片的差异基因4836个;通过韦恩图得到文冠果壳苷治疗阿尔兹海默症的潜在靶点50个;根据Dgree值大于中位数筛选出10个核心靶点;GO富集分析涉及57个生物过程、17个细胞组分、28个分子功能;KEGG富集分析得到33条相关信号通路;分子对接显示文冠果壳苷与9个核心靶点具有稳定的结合能力。结论 文冠果壳苷主要通过多靶点、多通路对阿尔兹海默症产生治疗效果。

关 键 词：阿尔兹海默症 文冠果壳苷 网络药理学 差异表达基因 

分 类 号：R749.1+6[医药卫生—神经病学与精神病学]