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机构地区:[1]广西大学学报编辑部,广西南宁530005 [2]广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530005
出 处:《广西农业生物科学》2008年第1期73-77,共5页Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science
基 金:国家973子课题项目(2004CB719606)
摘 要:以31个分子结构与生物活性(-lgIC50)已知的流感病毒神经氨酸酶抑制剂为训练集,选用16个分子的理化描述子,包括分子的形状,静电作用能和范德华作用能以及疏水描述子,用二维定量构效关系(2D-QSAR)方法建立了预测模型。计算中使用偏最小二乘(PLS)和主成分分析(PCA)降低变量维数,减少噪音干扰。用交叉验证法(leave one out,LOO)检验了预测模型的可信性,并用一个由4个抑制剂组成的测试集进一步验证预测模型的预测能力,证实了QSAR预测模型有较好的预测能力。神经氨酸酶抑制剂的QSAR预测模型的建立为抗流感药物的设计和改进提供了有用的研究工具。A QSAR predictive mode for neuraminidase inhibitor design was built using a training set consists of 31 molecules.In the QSAR calculation 16 molecular physicochemical descriptors were used,including molecular shape descriptor,electrostatic and Van der Waals interaction descriptor,and hydrophobic descriptor.Partial least square(PLS) and principal component analysis(PCA) were used to reduce the dimensions and noise error in training set.The QSAR predictive model was checked with the cross validation LOO(leave...
关 键 词:神经氨酸酶 抑制剂 抗流感药物 构效关系 药物设计
分 类 号:S859[农业科学—临床兽医学]
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