Armillariella tabescens阿拉伯糖苷酶基因全长cDNA的克隆与表达  

Cloning and expression of arabinosidase from Armillariella tabescens

作　　者：谢春芳[1] 黄辉[1] 姚冬生[1] 刘大岭[1] 梁郁强[1] 

机构地区：[1]暨南大学生物工程学系,广东广州510632

出　　处：《暨南大学学报（自然科学与医学版）》2006年第3期476-482,共7页Journal of Jinan University(Natural Science & Medicine Edition)

基　　金：国家高技术"863"计划项目(2002AA213001);广东省科技攻关计划项目(2005B20601004)

摘　　要：通过对假密环菌(Arm illariella tabescens)的表达cDNA克隆文库进行随机测序,获得一段与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列同源性很高的EST序列(AJ620046).根据获得的EST序列用SMART-RACE技术成功从假密环菌中克隆出了阿拉伯糖苷酶基因的全长cDNA,用生物信息学的方法对所获的序列进行信息学分析.分析结果显示其全长cDNA为1 016 bp,其最长的开放阅读框架为924 bp,编码307个氨基酸,该全长cDNA序列与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列具有较高同源性,80~279位氨基酸序列属于阿拉伯糖苷酶超家族,58~184位氨基酸是一个典型的结构功能域,蛋白分子质量预测为32 881 u,等电点为4.59.构建重组质粒pPIC9-AF,并在毕赤酵母菌GS115中对所获得的基因进行了表达,相对酶活达到了81.25%.Through random sequencing of an expression cDNA library of Armillariella tabescens,AJ620046 was detected that it has significant similarity to the arabinosidase of Bacteroides thetaiotaomicron.By using SMART-RACE technology,the full length cDNA of AJ620046 was obtained successfully.Analyzing with bioinformatics methods.Results showed the full-length cDNA has an open reading frame of 924 bp encoding a 307 amino acid protein.The full-length cDNA has significant similarity to the arabinosidase of Bacteroides t...

关 键 词：假密环菌 阿拉伯糖苷酶 生物信息学 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]