稻瘟病菌Rab族蛋白的结构及演化分析  被引量:1

Structure and Evolution of the Rab Family Proteins in Magnaporthe grisea

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作  者:张冬梅[1] 方坤海 石振华 王爱荣[1,2] 鲁国东[1] 王宗华[1] 

机构地区:[1]福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福州350002 [2]福建农林大学计算机与信息学院,福州350002

出  处:《热带作物学报》2009年第2期198-204,共7页Chinese Journal of Tropical Crops

基  金:福建省自然科学基金项目(No.B0520002);国家自然科学基金项目(No.30770071)资助。

摘  要:运用生物信息学方法,进行稻瘟病菌基因组中假定的Rab蛋白结构分析、建立系统进化树、预测Rab蛋白可能的组织和时空表达特点。结果表明,稻瘟病菌基因组共有11个假定的Rab蛋白成员,这些蛋白均含Ras超家族典型的结构域,但具有可以区别于Cdc42等Rho家族小GTP酶的特征,部分Rab成员表现出组织与时空表达的特异性;进一步系统进化分析表明,23种真菌Rab蛋白在进化树上聚成8个分枝,并显示出Rab蛋白的分化可能早于真菌种类的分化。Rab family proteins, mainly localized in endomembrane systems, are major members of the Ras superfamily, and act as the molecular switches and play pivotal roles in endomembrane transport system. To understand the function and evolution of the Rab family proteins in Magnaporthe grisea, bioinformatics approaches were used to conduct gene structure analysis, phylogenetic tree construction and prediction for gene expression temporarily and spatially at different organizations. In total, 11 putative Rab family ...

关 键 词:稻瘟病菌 RAB蛋白 系统进化 

分 类 号:S435.111.41[农业科学—农业昆虫与害虫防治]

 

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