系统进化

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茶树醛脱氢酶(ALDH)超家族的鉴定与表达分析
《农业生物技术学报》2025年第4期755-770,共16页刘丹丹 王雷刚 孙明慧 焦小雨 阮旭 吴琼 王文杰 
国家自然科学基金联合基金(U23A20213);安徽省茶叶产业技术体系(AHCYJSTX-11);安徽省农业科学院成果转化项目(2024YL041)。
醛脱氢酶(aldehyde dehydrogenases,ALDHs)在植物非生物胁迫下的醛稳态中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法鉴定茶树(Camellia sinensis)ALDH超家族成员,分析其编码的蛋白理化特性、染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件...
关键词:茶树 醛脱氢酶 全基因组鉴定 系统进化 非生物胁迫 
大麦典型硫氧还蛋白(TRX)基因家族鉴定与生物信息学分析
《作物杂志》2025年第2期66-73,共8页陈虎 高原 孙家猛 俞鹏 肖洪武 张海涛 
“十四五”国家重点研发计划(2022YFF1002903);国家自然科学基金(31871603)。
在栽培大麦MOREX全基因组水平下,利用TBtools、ExPASy、BUSCA、MEME、PlantCARE等在线工具对其染色体定位、理化性质、基因结构、保守结构域和启动子进行了预测分析。利用已发表的RNA-seq数据分析了典型TRX基因家族成员在大麦不同时期...
关键词:大麦 TRX基因家族 系统进化 表达分析 生物信息学 
多基因联用技术在虫草研究中应用进展
《食用菌学报》2025年第2期104-114,共11页朱新燕 鲍素敏 李春如 李增智 
对热休克蛋白基因(hsp70)、RNA聚合酶基因(rpb1和rpb2)、交配型基因(mat-alpha和matHMG)、18SrDNA(nrSSU)、28SrDNA基因(nrLSU)、ITS序列、真核翻译延伸因子(ef-1α)、微管蛋白基因(β-tubulin)、线粒体细胞色素基因(cytb和coI)和丝氨...
关键词:虫草 多基因 引物 系统进化 
火龙果叶绿体基因组结构与序列分析
《中国南方果树》2025年第2期103-107,113,共6页吴民富 李莎 谭艺涵 罗林 吴民华 黄琼林 
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515110332);湛江市科技计划项目(2019A01008)资助。
为解析火龙果Selenicereus undatus叶绿体基因组结构和序列特征,并探讨其系统进化关系,运用高通量测序技术开展火龙果叶绿体基因组测序,使用生物学信息技术对其组装和注释,分析其密码子偏好性、简单重复序列、与近缘物种间序列变异的关...
关键词:火龙果 叶绿体 基因组 序列分析 系统进化关系 
富民枳bZIP基因家族的鉴定和干旱胁迫表达
《东北林业大学学报》2025年第4期12-22,共11页张珊珊 张攀 杨文忠 
国家自然科学基金地区基金项目(31960278);云南省林业和草原科学院基金项目(MS2019-08、MS2019-09)。
为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚...
关键词:富民枳 BZIP 干旱胁迫 系统进化 表达分析 
宽叶十万错叶绿体基因组比较分析和系统进化关系研究
《中草药》2025年第5期1731-1746,共16页赵艳林 陈渊 沈晓婷 安昌 王振华 黄泽豪 黄鸣清 林彦翔 郑燕芳 
国家自然科学基金项目(32100168);福建省自然科学基金项目(2021J05061);福建中医药大学基础类学科科研提升计划项目(XJC2023008);福建中医药大学校管课题(X2023025);福建中医药大学高层次人才科研启动资金项目(X2020012-人才)。
目的以药用植物宽叶十万错Asystasia gangetica为研究对象,解析其叶绿体基因组结构特征,探究宽叶十万错在爵床族中的系统发育关系;方法利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对宽叶十万错叶绿体基因组进行测序,对其进行组装、注释和特征序...
关键词:宽叶十万错 叶绿体基因组 密码子偏好性 选择压力 序列变异 系统发育 
秋海棠属植物的花粉形态及其系统进化与分类学指示意义
《微体古生物学报(中英文)》2025年第1期71-83,共13页韦嘉胜 郝秀东 欧阳绪红 劳月英 薛美玲 秦琳娟 王艾岚 陆雅娴 
广西自然科学基金(批准号:2023GXNSFBA026263,2025GXNSFAA069308);国家自然科学基金项目(批准号:42001076,U20A2048和41861020);中国科学院南京地质古生物研究所古生物学与油气地层应用全国重点实验室(批准号:223109);广西岩溶动力学重大科技创新基地开放基金(KDL&Guangxi 202204);广西红树林保护与利用重点实验室开放基金(GKLMC-201902)联合资助。
采用光学显微镜和扫描电子显微镜对10种秋海棠属植物花粉形态进行观察研究,结果表明:花粉形态为长球形或超长球形,P/E为(1.61±0.13)−(2.18±0.11);花粉大小(P×E)为(15.09±0.81)μm×(9.06±0.32)μm~(28.3±0.87)μm×(15.95±0.76)...
关键词:花粉形态 秋海棠属 分类学 
药用植物两面针叶绿体基因组特征及系统进化分析
《林业与生态科学》2025年第1期83-92,共10页刘涵 孙冲 肖佳林 黄勤琴 刘华敏 黄威 黄姗 刘霞 
国家自然科学基金项目(31901324);重庆市教委青年项目(KJQN202201337,KJQN202201332,KJQN202101320,KJQN201801344);重庆市博士后特别资助项目(2021XM2010)。
为明确两面针叶绿体基因组的结构组成及其系统进化关系,研究花椒属物种遗传多样性、分子育种及野生种质资源开发利用,以两面针叶片为材料,利用改良CTAB法提取两面针叶片总DNA,基于BGISeq-500平台进行高通量测序,采用SPAdes v3.13.0软件...
关键词:叶绿体基因组 系统进化 种质资源 分子标记 两面针 
基于D-loop区多态性分析新疆地区7个哈萨克牛群体遗传结构和母系起源
《中国畜牧兽医》2025年第3期1166-1179,共14页王盼盼 沙拉玛提·波代 巴合提·博代 李振伟 吾热力哈孜·哈孜汗 
自然科学基金委地区基金项目(31960709)。
【目的】利用线粒体DNA(mtNDA)D-loop区序列多态性作为标记,探究新疆7个哈萨克牛群体间遗传结构和母系起源,为新疆黄牛品种合理利用和生物多样性保护提供资料。【方法】采集哈萨克牛血液提取DNA,测定179头哈萨克牛个体mtDNA D-loop序列...
关键词:哈萨克牛 线粒体DNA D-loop区 遗传多样性 系统进化 
叶绿体序列和核微卫星显示同域分布润楠属物种杂交严重
《广西植物》2025年第3期555-566,共12页蒋凯 王正伟 陈小勇 
上海市绿化和市容管理局项目(G232408,F132415)。
樟科润楠属(Machilus Nees)植物为常绿乔木,是亚热带常绿阔叶林常见的优势种,具有重要的经济价值,但属内分类和种间系统进化关系存在较大争议。为了解其可能的原因,该文选择12个同域分布的润楠属物种,采用72个叶绿体DNA序列片段和10个...
关键词:润楠属 叶绿体序列 核微卫星 系统进化 渐渗杂交 
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