系统进化关系

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火龙果叶绿体基因组结构与序列分析
《中国南方果树》2025年第2期103-107,113,共6页吴民富 李莎 谭艺涵 罗林 吴民华 黄琼林 
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515110332);湛江市科技计划项目(2019A01008)资助。
为解析火龙果Selenicereus undatus叶绿体基因组结构和序列特征,并探讨其系统进化关系,运用高通量测序技术开展火龙果叶绿体基因组测序,使用生物学信息技术对其组装和注释,分析其密码子偏好性、简单重复序列、与近缘物种间序列变异的关...
关键词：火龙果 叶绿体 基因组 序列分析 系统进化关系 
6种雪茄品系叶绿体基因组比较分析及系统发育关系研究
《特产研究》2025年第1期59-66,78,共9页施友志 申民翀 王剑 潘勇 杜甫 纪桂霞 赵泽玉 李子玮 王琰琰 贾志忠 袁晓龙 吴创 
湖北中烟工业有限责任公司重点科技项目(2021JCYL3SX2A006)。
为探究国内栽培雪茄烟的品系来源,本研究采用第二代测序技术对6种雪茄烟的叶绿体基因组进行了测序和组装,解析了其叶绿体基因组的结构特点,并构建其系统进化关系。结果表明,6种雪茄烟具有典型的叶绿体基因组的4个分区:大单拷贝区(Large ...
关键词：雪茄 叶绿体基因组 系统进化关系 种质资源 
1个侵染贵州火龙果的仙人指X病毒新的分离物基因组序列分析
《贵州农业科学》2025年第1期83-89,共7页郑乾明 王小柯 马玉华 
贵州省高层次创新型人才项目“百层次人才”(黔科合平台人才-GCC〔2022〕025-1);贵州省科技计划项目“贵州山地特色果树种质资源库创新能力建设”(黔科合服企〔2021〕8)。
【目的】分离侵染贵州火龙果的仙人指X病毒(Schlumbergera virus X,SchVX)基因组全长序列,了解其系统进化和遗传变异,为开展贵州火龙果病毒检测和防控奠定基础。【方法】从前期开展的火龙果成熟茎全长转录组测序获得的转录本中筛选SchV...
关键词：火龙果 仙人指X病毒 外壳蛋白 序列一致率 系统进化关系 
五爪金龙叶绿体基因组特征分析
《广西科学》2024年第3期451-458,共8页黄琼林 陈依虹 叶晓霞 谭靖怡 梁秋婷 吴民华 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116);广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113);广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113,GDMU2022125)资助。
为了阐明药用植物五爪金龙Ipomoea cairica的叶绿体基因组特征,选用五爪金龙叶片为样品,采用试剂盒法提取DNA并建立测序文库,随后使用新一代细胞器基因组测序技术进行高通量测序,并利用生物信息学手段进行序列组装和特征分析。结果显示...
关键词：五爪金龙 叶绿体基因组 密码子偏好性 简单重复序列 系统进化关系 
五指毛桃叶绿体基因组结构与序列特征分析被引量：1
《福建农林大学学报（自然科学版）》2024年第3期323-331,共9页黄琼林 谭靖怡 叶晓霞 梁秋婷 蒲柳池 吴民华 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116);广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113);广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113、GDMU2022125)。
【目的】阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息。【方法】采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系...
关键词：五指毛桃 叶绿体基因组 密码子偏好性 简单重复序列 序列比对 系统进化关系 
了哥王叶绿体基因组分析
《浙江农林大学学报》2024年第2期297-305,共9页吴民华 叶晓霞 谭靖怡 梁秋婷 吴子健 黄琼林 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116);广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113);广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113,GDMU2022125)。
【目的】阐明药用植物了哥王Wikstroemia indica的叶绿体基因组结构特点及系统进化地位,为了哥王的资源保护和可持续利用提供科学依据。【方法】采用Illumina测序平台进行了哥王叶绿体基因组测序,并通过生物信息技术和软件进行序列拼接...
关键词：了哥王 叶绿体基因组 密码子偏好性 简单重复序列 序列比对 系统进化关系 
苹果小G蛋白MdoROP的进化分类、结构及理化特性分析
《生物技术》2024年第1期35-46,共12页刘礼瑶 何璐 赵博 熊仁次 杨叔青 
国家自然科学基金项目(32160644);塔里木大学校长基金项目(TDZKBS202101);2018年度新疆建设兵团科技特派员项目“南疆无公害设施农业生产基地建设与示范”(BT1720180017G)。
[目的]获取6个MdoROP蛋白并对其基序组成、系统进化关系、蛋白结构及理化特性进行分析。[方法]取苹果叶片进行离体接菌,利用SMARTS和MEGA 11等多种生物信息学软件对其进行预测分析。[结果]基于蛋白基序的组成差异可将MdoROP蛋白归为同...
关键词：苹果 小G蛋白MdoROP 系统进化关系 理化特性 蛋白结构 
甘蔗野生种割手密叶绿体基因组特征及种内系统进化关系
《基因组学与应用生物学》2023年第12期1295-1310,共16页余熙恺 余泽怀 张清 张兴坦 
国家自然科学基金项目(32222019,32201794)共同资助。
甘蔗野生种割手密(Saccharum spontaneum)为栽培种甘蔗提供了对多种病原菌与逆境具有抗性的优良性状。本研究基于已发表的群体重测序数据,组装并注释了来自亚洲、地中海、印度次大陆、非洲等地域的64个割手密的叶绿体基因组。组装结果显...
关键词：甘蔗属 割手密 叶绿体基因组 系统发育分析 生物信息学 
“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系被引量：1
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》2023年第6期699-707,717,共10页王宁 彭晗琪 高常哲 程羽珩 吕大兵 
国家自然科学基金(81971957)。
目的测定具有“夜逸蚴”特征的日本血吸虫线粒体全基因组序列,并探讨其与大陆其他日本血吸虫地域株的系统进化关系,为后续进行种群遗传结构与遗传多样性研究提供新的数据。方法2020年于安徽省石台县现场采集钉螺,实验室内分离感染性钉螺...
关键词：线粒体基因组 序列分析 系统进化关系 日本血吸虫 夜逸蚴特征 
黄河上游部分地区密点麻蜥mtDNA的系统进化关系
《中文科技期刊数据库（全文版）自然科学》2023年第9期65-68,共4页杜晓阳 马钰 余忠兰 蔡磊 李 铀 
国家自然科学基金地区科学基金项目(32060311)。甘肃省自然科学基金项目(20JR10RA124)。西北民族大学中央高校基本科研业务费项目(31920210143,31920190083)。
本试验使用了线粒体ATP6基因组和Cytb基因组序列进行了PCR扩增和测定,用邻接法(Neighbor-joining,NJ树)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)分别构建了系统的进化树并进行系统发育分析,以研究在我国黄河上游的部分地区,密点麻蜥种群遗...
关键词：MTDNA 密点麻蜥 系统发育分析 
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