简单重复序列

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红松种源遗传多样性评价和育种群体构建
《森林与环境学报》2025年第3期273-282,共10页尚福强 马晓雨 高源 张利民 张丽艳 
辽宁省重点研发计划项目“红松优良种质资源收集与利用研究”(2020JH2/10200020);辽宁省农业科学院学科绩效后补助项目“基于种实性状和分子标记的红松群体遗传多样性研究”(2023-HBZ-1010);辽宁省农业科学院院长基金项目“基于SSR标记的红松种子园无性系遗传多样性分析及分子身份证构建”(2024QN1817)。
为满足红松种质资源评价、发掘与利用的需求,以辽宁、吉林以及黑龙江的12个红松种源为研究对象,采用形态学和分子标记相结合的方法对红松种源进行遗传多样性分析以及育种群体构建,探究不同种源红松形态和分子的遗传多样性分化。结果表明...
关键词：红松 生长性状 简单重复序列 遗传多样性 育种群体 
狼尾草属叶绿体基因组特征与分子标记开发
《浙江农林大学学报》2025年第2期365-372,共8页江转转 陈红 鲍红艳 代雨童 
武汉大学杂交水稻全国重点实验室开放课题(KF202204);安徽省高等学校科学研究项目(2022AH051034,2022AH051048);安徽省中青年教师行动培养计划(JWFX2023027);安徽省大学生创新创业训练项目(S202310372079)。
【目的】利用4种已发布的狼尾草属Pennisetum植物叶绿体基因序列,分析其叶绿体基因组特征并开发相应的分子标记,为狼尾草属植物的进化及系统发育关系提供新的观点。【方法】基于美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库已发布的4种狼尾草...
关键词：狼尾草属 叶绿体基因组 分子标记 简单重复序列(SSR) 
原生质体融合获得羊肚菌黑色栽培种与黄色非栽培种间杂交高产菌株
《江西农业大学学报》2025年第2期349-359,共11页廖武俊 钟啟萍 李荣光 霍达 霍光华 
江西省重点研发计划项目(20203BBF63036)。
【目的】目前限制江西地区羊肚菌产业发展的主要问题为产量低、高产难重复及优质菌种少,而解决这些问题的关键在于菌种。本研究旨在选育适合江西本土栽培的高产羊肚菌新菌株。【方法】根据遗传与环境互作理论,有针对性的选择江西本土采...
关键词：羊肚菌 高产羊肚菌新菌株A11 紫外和热双灭活 原生质体融合 区间简单重复序列标记分析 
落叶松-杨栅锈菌全基因组水平简单重复序列(SSRs)特征分析及新型SSR标记开发
《植物病理学报》2025年第2期251-260,共10页周显臻 王华 曹支敏 于丹 
国家自然科学基金(31870630);陕西省自然科学基础研究计划(2018JM3043)。
由落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina)侵染杨树叶片引起的杨树叶锈病是一种分布广泛且危害严重的杨树叶部病害。简单重复序列(Simple sequence repeats,SSRs)广泛分布于基因组中,不仅常作为遗传标记用于群体遗传学分析,也在...
关键词：落叶松-杨栅锈菌 SSR特征 多态性预测 SSR标记 
基于Nanopore技术的马铃薯甲虫全长转录组测序研究
《植物检疫》2025年第1期1-7,共7页李红卫 张柳 李彤 丁晓宇 于艳雪 
中国检验检疫科学研究院基本科研业务费项目(2022JK09)。
为深度挖掘马铃薯甲虫的转录组信息与功能基因,本研究采用Nanopore测序技术,针对马铃薯甲虫触角混合组织展开全长转录组测序,成功构建了该物种的全长转录本文库。在研究过程中,通过对转录组数据进行生物信息学分析,完成可变剪接分析、...
关键词：马铃薯甲虫 全长转录组 转录因子 简单重复序列 长链非编码RNA 第三代测序技术 纳米孔测序 
脆蜜金柑果肉转录组SSR分布及其序列特征分析
《南方农业学报》2025年第2期583-591,共9页黄秋岚 田程飘 刘功德 毛立彦 邓小红 龙凌云 
广西重点研发计划项目(桂科AB19245035);国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项(nycytxgxcxtd-2021-05-03);广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2022YM16,桂农科2021YT143)。
【目的】分析脆蜜金柑果肉转录组中简单重复序列(SSR)的分布情况及序列特征,为金柑属的遗传多样性分析、SSR分子标记开发及分子辅助育种等提供参考依据。【方法】以脆蜜金柑为试验材料,通过DNBSEQ-G99高通量测序平台对其果肉组织进行转...
关键词：脆蜜金柑 转录组 简单重复序列(SSR) 序列特征 重复基元 
基于SSR荧光标记的花果兼用梅遗传多样性分析和分子身份证构建
《生物工程学报》2025年第2期639-656,共18页王梓煦 周丹 赵彦贝 童宇航 郑为军 李庆卫 
国家重点研发计划(2020YFD1000500);北京园林绿化增彩延绿科技创新工程(2019-KJC-02-10);北京林业大学建设世界一流学科和特色发展引导专项资金项目(2019XKJS0324)。
为了收集、鉴定、评价和创新花果兼用梅(Prunus mume)优良种质,推动我国北方地区梅产业链的改造升级,对花果兼用梅(Prunus mume)种质进行遗传多样性分析,构建DNA分子身份证数据库,本研究以河北省邢台68份花果兼用梅为材料,采用多态性好...
关键词：梅 花果兼用 遗传多样性 简单重复序列荧光标记 分子身份证 
中甸刺玫的叶绿体基因组特征及种内变异
《广西植物》2025年第1期15-30,共16页王其刚 曹世睿 王慧纯 马长乐 晏慧君 邱显钦 景维坤 蹇洪英 
国家自然科学基金(31972443);云南省高层次科技人才及创新团队选拔专项(202305AS350002)。
中甸刺玫(Rosa praelucens)是云南香格里拉市的特有“极危”植物和国家二级重点保护植物,也是著名的高山花卉和重要的十倍体月季种质资源,种内存在丰富的表型多样性。为了澄清中甸刺玫种内表型变异的遗传背景,该文利用二代测序技术对40...
关键词：中甸刺玫 叶绿体基因组 比较基因组 简单重复序列 核酸多态性 密码子偏好 
丁香杜鹃(Rhododendron farrerae)叶绿体基因组特征及分析
《分子植物育种》2025年第2期600-607,共8页申建双 黄璐 荣先林 
国家自然科学基金项目(32201608);杭州职业技术学院人才科研项目(RCXY202303)共同资助。
本研究采用Illumina高通量测序技术对丁香杜鹃(Rhododendron farrerae)的叶绿体基因组进行了全面测序与分析,包括基因组特征、密码子偏好性以及简单重复序列(SSR)的鉴定与研究。结果显示,丁香杜鹃的叶绿体基因组大小为149453 bp,不具备...
关键词：丁香杜鹃 叶绿体基因组 密码子偏好性 简单重复序列 分子标记 
千里光叶绿体基因组特征及系统发育分析
《中国野生植物资源》2025年第1期65-73,共9页孔卫青 江微 杨金宏 
陕西省重点研发计划项目(2020NY-138);陕西省教育厅重点科学研究计划项目(20JS003)。
目的:研究中药材千里光的叶绿体基因组特征,为千里光属植物的系统发育关系和进化研究提供依据。方法:通过高通量测序获得千里光的叶绿体基因组,Codon W、MISA、REPuter、MAFFT等软件分析其密码子偏好、SSR、重复序列、核苷酸多态性、系...
关键词：千里光 叶绿体基因组 简单重复序列 遗传多样性 系统发育 
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