叶绿体基因组

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大花水蓑衣叶绿体基因组特征及系统发育分析
《天津中医药》2025年第5期638-646,共9页张婷婷 张悦 邢志美 李慧 田晓轩 
[目的]对大花水蓑衣及其同属近源物种Hygrophila sp.叶绿体基因组进行测序和分析,解析叶绿体基因组结构特征、探究系统发育位置和进化关系。[方法]对大花水蓑衣及其同属近源物种Hygrophila sp.的叶绿体基因组进行测序,借助生物分析学方...
关键词：大花水蓑衣 广天仙子 叶绿体基因组 系统发育分析 
小果油茶与越南油茶中叶绿体基因组密码子偏好性
《北京林业大学学报》2025年第4期37-49,共13页张菲菲 朱艳 韩长志 
云南省研究生导师团队建设项目(2022100);云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(YNWR-QNBJ-2020-188)。
【目的】研究小果油茶和越南油茶中叶绿体基因组密码子的使用模式,分析并揭示两个物种密码子使用偏好性产生的原因,明确两个物种叶绿体基因组中的最优密码子,为油茶基因组研究和良种培育提供理论依据。【方法】运用Codon W 1.4.2和在线...
关键词：小果油茶 越南油茶 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
狼尾草属叶绿体基因组特征与分子标记开发
《浙江农林大学学报》2025年第2期365-372,共8页江转转 陈红 鲍红艳 代雨童 
武汉大学杂交水稻全国重点实验室开放课题(KF202204);安徽省高等学校科学研究项目(2022AH051034,2022AH051048);安徽省中青年教师行动培养计划(JWFX2023027);安徽省大学生创新创业训练项目(S202310372079)。
【目的】利用4种已发布的狼尾草属Pennisetum植物叶绿体基因序列,分析其叶绿体基因组特征并开发相应的分子标记,为狼尾草属植物的进化及系统发育关系提供新的观点。【方法】基于美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库已发布的4种狼尾草...
关键词：狼尾草属 叶绿体基因组 分子标记 简单重复序列(SSR) 
基于叶绿体基因组的中国水麦冬科系统发育研究
《水生生物学报》2025年第4期154-166,共13页王璐瑶 周全 樊国有 袁庆 张晶晶 刘海瑞 
西宁市重大科技专项(2023-Z-13);中国科学院西部之光青年学者项目(xbzglzb2022043)资助
为探究水麦冬科(Juncaginaceae)系统发育上存在的争议,并丰富水麦冬科物种的遗传信息资源,研究对海韭菜(Triglochin maritima)和水麦冬(Triglochin palustris)叶绿体基因组进行测序、组装、注释和特征分析,并重建其与相关类群的系统发...
关键词：水麦冬科 叶绿体基因组特征 系统发育 分歧时间 
11种铁皮石斛叶绿体基因组分析及分化时间推算
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2025年第2期291-302,共12页周宇 刘苑坤 方玉占 周坚宏 陈家悦 
研究不同产地来源的铁皮石斛(Dendrobium officinale)遗传差异性,有利于深入了解铁皮石斛物种起源与分化,为铁皮石斛种质资源的保护提供理论依据。本研究分析了11种不同产地来源的铁皮石斛叶绿体基因组结构及特征。结果表明:11种铁皮石...
关键词：铁皮石斛 叶绿体基因组 序列分析 分化时间 
云南核桃古树资源与选育品种的叶绿体基因组遗传变异分析
《西部林业科学》2025年第2期22-31,共10页吴涛 马婷 肖良俊 陈少瑜 王高升 潘莉 宁德鲁 
国家自然科学基金(32160697),科技人才与平台计划(202405AC350009,202405AK340006);云南省种子种业联合实验室(202205AR070001-15)。
为解析云南省古树核桃与选育品种的叶绿体基因组遗传变异特征,以云南7个州市的136份古树核桃资源和60份审认定核桃品种(无性系)为研究对象,利用二代测序数据组装并注释其叶绿体基因组(cpDNA),开展cpDNA结构特征、序列多态性、单倍型网...
关键词：深纹核桃 云南 古树资源 选育品种 叶绿体基因组 遗传变异 
‘槠叶齐’叶绿体与线粒体基因组密码子偏好性分析
《茶叶科学》2025年第2期201-218,共18页曾文娟 朱友鹏 陈嘉欣 李洪玉 王双辉 龚意辉 陈致印 
湖南省自然科学基金(2023JJ50465);湖南省科技创新计划项目(2024RC8289);娄底市科技创新计划项目(2023RC3501);国家级大学生创新训练项目(S202310553022)。
密码子使用偏好性作为基因表达调控与分子进化的重要驱动力,在植物细胞器基因组研究中具有特殊意义。‘槠叶齐’(Camellia sinensis cv.‘Zhuyeqi’)作为中国重要的茶树品种,其细胞器基因组密码子使用模式尚未见系统报道。本研究对‘槠...
关键词：槠叶齐 叶绿体基因组 线粒体基因组 密码子使用偏好性 最优密码子 
蓼属叶绿体基因组密码子偏好性分析及比较特征
《中国农业科技导报(中英文)》2025年第4期87-98,共12页刘起麟 李金泽 丁佳渝 王烁理 程子铭 古康圆 冯光燕 
国家重点研发计划项目((2021YFD1200105));四川省饲草育种攻关项目(2021YFYZ0013);2024年大学生创新训练计划项目(202410626020)。
为探究蓼属植物叶绿体基因组的结构、功能和进化特征,利用CodonW、SPSS软件和在线程序Galaxy、Genepioneer生信云、mVISTA、GENE DENOVO等工具,对28种蓼属植物叶绿体基因组的密码子使用偏好性和系统发育关系进行分析。结果表明,28种蓼...
关键词：蓼属 叶绿体基因组 密码子偏好性 比较特征 系统发育 
不同来源广藿香叶绿体基因组研究
《广西植物》2025年第4期716-729,共14页行冰楠 梁莹莹 吴文如 陆亚茹 邹何元 彭晓祺 
中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302);广州中医药大学大学生创新创业训练计划项目(202210572232)。
为探究广藿香(Pogostemon cablin)叶绿体基因组的结构特征,比较不同来源广藿香叶绿体基因组的差异,该研究利用DNBSeq测序平台对广藿香全基因组进行测序,使用GetOrganelle组装完整的广藿香叶绿体基因组,通过CPGAVAS2网站对该叶绿体基因...
关键词：广藿香 叶绿体基因组 重复序列 多样性 同义密码子相对使用度 
疏花地榆的叶绿体基因组和系统位置分析
《内蒙古师范大学学报(自然科学版)》2025年第2期120-124,共5页红良 张国建 李琴琴 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目“中国地榆属比较叶绿体基因组学及DNA条形码研究”(2022LHQN03004)。
对疏花地榆(Sanguisorba diandra)叶绿体基因组的研究发现,其基因组为环状结构,全长为154832 bp,GC含量37.3%;基因组呈典型的四分体结构,包括一个大单拷贝区(large single copy region,LSC)、一个小单拷贝区(small single copy region,S...
关键词：疏花地榆 叶绿体基因组 地榆属 蔷薇科 
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