分歧时间

作品数:42被引量:206H指数:8
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相关机构:中国科学院中国科学院大学安徽师范大学中国科学院南京地质古生物研究所更多>>
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基于叶绿体基因组的中国水麦冬科系统发育研究
《水生生物学报》2025年第4期154-166,共13页王璐瑶 周全 樊国有 袁庆 张晶晶 刘海瑞 
西宁市重大科技专项(2023-Z-13);中国科学院西部之光青年学者项目(xbzglzb2022043)资助
为探究水麦冬科(Juncaginaceae)系统发育上存在的争议,并丰富水麦冬科物种的遗传信息资源,研究对海韭菜(Triglochin maritima)和水麦冬(Triglochin palustris)叶绿体基因组进行测序、组装、注释和特征分析,并重建其与相关类群的系统发...
关键词:水麦冬科 叶绿体基因组特征 系统发育 分歧时间 
吊灯扶桑叶绿体基因组特征与木槿属系统发育研究
《草地学报》2025年第3期748-765,共18页周全 王璐瑶 袁庆 郑雪梅 刘海瑞 
中科院西部之光青年学者项目“青藏高原莛子藨与穿心莛子藨遗传多样性及物种分化研究”(xbzglzb2022043);西宁市重大科技专项“西宁植物多样性资源调查与种质资源圃建设”(2023-Z-13)资助。
为探讨木槿属系统发育关系,明确争议类群的分类学地位。本研究对吊灯扶桑(Hibiscus schizopetalus)完整叶绿体基因组进行了测序组装,并从NCBI数据库中下载已公布的木槿属及近缘类群叶绿体基因组。使用DnaSP、MrBayes和MCMCtree等生物信...
关键词:吊灯扶桑 叶绿体基因组 木槿属 系统发育 分歧时间 
2016年~2022年福建地区猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析被引量:20
《中国预防兽医学报》2024年第1期84-91,共8页李雨琪 许静茹 郑欣 黄林洁 周娴静 朱智豪 陈芳婷 邓莹滋 蔡思思 靳雨欣 刘璐 董波 戴爱玲 李晓冰 范克伟 
福建省农业科技重大专项项目(2019NZ09005);福建省高校产学合作项目(2020N5012);福建省高校新世纪优秀人才支持计划项目(闽教科[2018]47号);中央引导地方科技发展专项项目(2021L3028);国家级大学生创新创业训练计划项目(202011312012、202111312006、202311312009);新罗区产学研科技联合创新项目(2022XLXYZ009)。
为了解2016年~2022年福建地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行现状及遗传变异情况,本研究对从福建地区采集的231份疑似猪流行性腹泻(PED)发病仔猪病料样品经RT-PCR进行PEDV的检测,选取不同地区22份PEDV阳性样品经PCR扩增S基因并测序,采用Meg...
关键词:猪流行性腹泻病毒 S基因 遗传变异 基因重组 分歧时间 
陆川小笠贝线粒体全基因组测序及笠贝科系统发育分析
《水生生物学报》2023年第8期1248-1260,共13页苗菁 李继姬 叶莹莹 郭宝英 徐开达 
浙江省省属高校基本科研业务费项目(2021J005);舟山市科技计划项目(2021C21017)资助。
为对笠贝科进行系统发育分析,研究通过二代测序技术得到了陆川小笠贝(Lottia luchuana)的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有38个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个RNA,23个tRNA。对碱基含量分析发现T碱基含...
关键词:笠贝科 笠形腹足亚纲 线粒体基因组 系统发育分析 分歧时间 
芦竹属菌草的分子鉴定及适应性进化分析被引量:1
《草业科学》2023年第6期1568-1581,共14页孙源长 王天友 罗琳 蔡杨星 林辉 林冬梅 张积森 林占熺 
福建省重大专项“菌草种质创新及其产业化利用关键技术研究与应用”(2021NZ029009);福建省农业农村厅农业资源保护与利用专项(KKY22001XA)。
目前芦竹属(Arundo)菌草形态学的鉴定方法已经建立,但是在分子水平上的研究较少。对芦竹属菌草进行分子鉴定与选择压力分析可为菌草的杂交育种奠定基础。本研究通过PCR扩增得到芦竹属菌草的ITS2基因序列,并对它们的叶片进行转录组测序,...
关键词:芦竹 ITS2序列 系统发育 转录组 分歧时间 选择压力 
因式分解法在分子系统发育分析中的应用
《太原师范学院学报(自然科学版)》2022年第4期76-81,共6页李可群 
使用因式分解法给出了两物种类群物种选择规则,即为其分子进化替代公式与推导公式总误差取最小值时目标函数一阶偏导数方程组的解,并证明了从计算出物种分歧时间与化石年龄一致的成功体系数据中总结出的公式是其中的一个解.该公式能极...
关键词:分子系统发育分析 物种选择规则 分歧时间 因式分解 
分子系统发育分析中的“病态方程组”问题被引量:1
《赣南师范大学学报》2021年第3期24-29,共6页李可群 
从数学上证明了,在已知一个绝对分歧时间的三物种体系和四物种体系中,推导公式的雅可比矩阵转置矩阵通过初等变换可实现2行相等.推导公式因为“病态方程组”问题不能得到其他物种分歧时间的准确计算结果,而替代公式因无“病态方程组”...
关键词:推导公式 替代公式 雅可比矩阵 初等变换 病态方程组 物种分歧时间 
基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜䴕系统发育分析和分歧时间估算被引量:1
《野生动物学报》2021年第1期143-150,共8页元青苗 段玉宝 
国家级大学生创新创业训练计划支持项目(20191067726);云南省科技计划项目(2019FD070)。
随着分子生物技术的迅速发展,物种分化的过程及原因成为进化生物学和生态学研究的热点之一。黄腰响蜜䴕(Indicator xanthonotus)是中国分布的唯一的响蜜䴕科鸟类,其系统发生关系和分化时间尚不清楚。本文运用细胞色素c氧化酶I亚基(COI)和...
关键词:黄腰响蜜䴕 COI基因 CYTB基因 系统发育 分歧时间 
分子系统发育分析中的物种选择规则被引量:3
《青海师范大学学报(自然科学版)》2021年第1期6-12,18,共8页李可群 
数学上推导了二物种类群体系、三物种类群体系和四物种类群体系的物种选择规则,使替代公式引入的总体误差取最小值是物种选择规则的原理.
关键词:分子系统发育分析 物种选择规则 泊松分布 分歧时间 计算 
叶绿体基因组在药用植物鉴定及系统进化研究中的应用被引量:36
《世界中医药》2020年第5期702-708,716,共8页姜汶君 郭梦月 庞晓慧 
国家自然科学基金面上项目(81573541)。
叶绿体是细胞内具有自主遗传信息的重要细胞器,近年来叶绿体基因组已发展成为近缘物种分子标记、揭示植物进化和系统发育关系的有力工具。药用植物是人类赖以生存和发展的自然资源,叶绿体基因组在药用植物研究中的应用价值受到广泛关注...
关键词:药用植物 叶绿体基因组 物种鉴定 DNA条形码 高变异区 系统进化 分歧时间 基因工程 
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