分子系统发育分析

作品数：41被引量：151H指数：7
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相关作者：李可群钟扬何艳霞李文付涛更多>>
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相关期刊：《太原师范学院学报（自然科学版）》《菌物学报》《中国人兽共患病学报》《核农学报》更多>>
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PhyloSuite:生物领域分子系统发育分析新平台
《科学观察》2023年第6期35-37,共3页张东 李文祥 王桂堂 
生物领域的分子系统发生学(molecular phylogeny)是利用生物的DNA、蛋白质序列等各种分子数据构建生物实体之间的起源和演化关系。20世纪80年代后期,随着保守引物PCR扩增和DNA测序技术的应用,系统发生(也称系统发育)研究迎来了分子数据...
关键词：DNA测序技术 生物实体 分子序列 蛋白质序列 数据构建 形态数据 起源和演化 
因式分解法在分子系统发育分析中的应用
《太原师范学院学报（自然科学版）》2022年第4期76-81,共6页李可群 
使用因式分解法给出了两物种类群物种选择规则,即为其分子进化替代公式与推导公式总误差取最小值时目标函数一阶偏导数方程组的解,并证明了从计算出物种分歧时间与化石年龄一致的成功体系数据中总结出的公式是其中的一个解.该公式能极...
关键词：分子系统发育分析 物种选择规则 分歧时间 因式分解 
基于中国科学院菌物标本馆馆藏标本的中国蜡蘑属分类研究
《菌物研究》2022年第4期271-284,共14页王科 刘冬梅 李国杰 刘铁志 谢孟乐 杜卓 魏铁铮 
生态环境部生物多样性调查与评估项目(2019HJ2096001006);中国科学院战略生物资源服务网络计划生物标本馆经典分类学青年人才项目(ZSBR-001)。
基于系统发育方法,通过对中国科学院微生物研究所菌物标本馆(HMAS)馆藏的2000年之后采集的蜡蘑属标本开展了分子鉴定和分类学研究,共发现16个种,其中包括新种炭黑蜡蘑Laccaria anthracina和3个中国新记录种(蛛网蜡蘑Laccaria araneosa...
关键词：大型真菌 分类学 ITS序列 分子系统发育分析 
基于COⅠ、16S rRNA &18S rRNA基因的蚱亚科部分种类分子系统发育分析被引量：1
《基因组学与应用生物学》2022年第5期970-980,共11页黄超梅 邓维安 张荣娇 贺晨曦 
国家自然科学基金项目(31960111、31900351);广西师范大学人才项目(DC2100001024);河池学院高层次人才科研项目(2019GCC009)共同资助
本研究扩增和测定了蚱亚科9属30种昆虫的COⅠ、16S rRNA和18S rRNA基因,对联合序列的碱基组成和种间遗传距离进行了分析,同时采用最大似然法(maximum likelihood method, ML)和贝叶斯法(bayesian inference method, BI)构建了分子系统...
关键词：蚱总科 蚱亚科 COⅠ 16S rRNA 18S rRNA 系统发育 分类学 
使用序列差异率直接确定分子系统发育分析中的物种组成
《南宁师范大学学报（自然科学版）》2022年第1期105-111,共7页李可群 
数学上推导出使用序列差异率和参照类群来计算三物种类群体系计算框图中各进化区段平均未突变概率的公式,还提出了选择满足文献物种选择规则要求物种类群的方法,并使用寒武纪物种分歧时间计算体系进行了验证,所得结果令人满意,四物种类...
关键词：序列差异率 分子系统发育分析 物种组成 参照类群 平均未突变概率 
中国淡水胭脂藻属植物形态及分子系统发育分析
《水生生物学报》2021年第6期1341-1350,共10页南芳茹 李娟 刘旭东 冯佳 刘琪 吕俊平 谢树莲 
国家自然科学基金(31800172,31670208和41871037)资助。
以云南省玉溪市和河南省焦作市新采集的2株淡水胭脂藻标本为材料,对其进行形态特征观察和分子系统发育分析,联合我国已报道的其他胭脂藻序列信息,构建该属植物可靠的系统发育关系。根据其现代地理分布模式,对胭脂藻属进行了祖先地理起...
关键词：淡水胭脂藻 形态特征 RBCL PSBA UPA 系统发育 祖先地理起源 
基于分子系统发育分析的京冀太行山区丝膜菌属分类研究被引量：3
《聊城大学学报（自然科学版）》2021年第5期72-87,共16页王科 刘冬梅 李国杰 杜卓 郭耀宾 谢孟乐 魏铁铮 
国家自然科学基金项目(31270072);生态环境部生物多样性调查与评估项目(2019HJ2096001006);中国科学院战略生物资源服务网络计划生物标本馆经典分类学青年人才项目(ZSBR-001)资助。
基于ITS序列,运用最大似然法构建系统发育树,结合形态特征,对采集自北京市和河北省境内太行山区的丝膜菌属(Cortinarius)真菌标本进行分类鉴定。本文报道了这一研究发现的29个物种,其中18个种为中国新记录种。此外,基于模式标本序列分...
关键词：大型真菌 分类学 ITS序列 分子系统发育分析 
分子系统发育分析中的“病态方程组”问题被引量：1
《赣南师范大学学报》2021年第3期24-29,共6页李可群 
从数学上证明了,在已知一个绝对分歧时间的三物种体系和四物种体系中,推导公式的雅可比矩阵转置矩阵通过初等变换可实现2行相等.推导公式因为“病态方程组”问题不能得到其他物种分歧时间的准确计算结果,而替代公式因无“病态方程组”...
关键词：推导公式 替代公式 雅可比矩阵 初等变换 病态方程组 物种分歧时间 
分子系统发育分析中的物种选择规则被引量：3
《青海师范大学学报（自然科学版）》2021年第1期6-12,18,共8页李可群 
数学上推导了二物种类群体系、三物种类群体系和四物种类群体系的物种选择规则,使替代公式引入的总体误差取最小值是物种选择规则的原理.
关键词：分子系统发育分析 物种选择规则 泊松分布 分歧时间 计算 
分子系统发育分析揭示中国云南省间座壳属两个新种被引量：4
《菌物学报》2021年第3期436-446,共11页董皓 穆太昌 张兆学 张修国 夏吉文 
Supported by the National Natural Science Foundation of China(31900014,31770016,31750001)。
间座壳属真菌在多种经济上重要的农作物、观赏植物和森林树木上常作为植物病原菌、内生菌或腐生菌被人熟知。本研究调查我国云南省患病植物叶片上的间座壳属真菌,通过核糖体内部转录间隔区、β微管蛋白基因、翻译延伸因子基因、钙调蛋...
关键词：间座壳目 形态学 系统学 分类学 
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