比较基因组

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龟鳖目表皮分化复合体基因的比较基因组学鉴定与分析
《水生生物学报》2025年第5期102-120,共19页陈孟饶 李芳 陈其然 黄保友 孙伟 钱国英 葛楚天 王宗吉 
国家自然科学基金(32102772);宁波市自然科学基金(2023J043);浙江省高校基础科研经费项目;2022年浙江省“生物工程”一流学科(ZS2022008)资助。
发掘龟鳖表皮分化复合体(Epidermal Differentiation Complex,EDC)基因的序列特征和进化有助于解析其甲壳表皮特征的遗传基础和演化历史。文章对28个龟鳖的EDC基因进行了比较基因组学鉴定,染色体定位、氨基酸含量、结构域、蛋白空间结...
关键词：表皮分化复合体 氨基酸组成 基因扩张 EDPCV基因 龟鳖 
亚洲叶猴比较基因组学的研究进展
《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》2025年第4期168-171,共4页王璐 郑立雕 
感谢乐山师范学院西南山地濒危鸟类保护四川省高等学校重点实验室平台基金(203230025);乐山师范学院培育项目(205220114);乐山市科学技术局项目(24YYJC0018)。
亚洲叶猴隶属于猴科(Cercopithecidae)和疣猴亚科(Colobinae),以其独特的叶食性和快速的辐射进化著称。现存的亚洲叶猴包括七个属,分布广泛且占据多样的生态位。丰富的亚洲叶猴基因组数据为探讨其进化历史、系统发育关系及适应性进化提...
关键词：亚洲叶猴 基因组 比较基因组学 进化历史 适应性演化 
基于糖苷水解酶家族基因的双歧杆菌比较基因组学分析及其在两歧双歧杆菌分离中的应用
《食品科学》2025年第5期114-123,共10页李岩 于航 陈思远 姜楠 赵鹏昊 孟祥晨 
国家自然科学基金面上项目(32272291)。
本研究旨在比较分析双歧杆菌共有与特有的糖苷水解酶家族基因,在此基础上建立一种从婴儿粪便样本中快速分离目标双歧杆菌的方法。首先比较分析短双歧杆菌(Bifidobacterium breve)、长双歧杆菌长亚种(B. longum subsp. longum)、两歧双...
关键词：比较基因组学 糖苷水解酶 双歧杆菌属 分离鉴定 
细点石斑鱼的基因组注释及比较基因组学分析
《水产研究》2025年第1期10-19,共10页王垚鑫 贾磊 尚晓迪 于燕光 王钢 刘厚孚 陈春秀 李翔 
天津市农业发展服务中心青年科技创新项目(zxkj202448),天津市农业发展服务中心青年科技创新项目(zxkj202445),国家海水鱼产业技术体系(CARS-47-Z01),天津市农业产学研用“揭榜挂帅”项目(GBTG202301)。
细点石斑鱼(Epinephelus cyanopodus),隶属于鲈形目、鮨科、石斑鱼属,是一种栖息于暖水礁区的肉食性鱼类。目前国内已实现人工养殖,但在苗种生产过程中面临雄性亲本获取困难的问题,性别调控的关键基因尚不明确。本试验通过转录组测序、...
关键词：细点石斑鱼 比较基因组学 褪黑素 性别调控 基因组注释 
一株分离自运城盐湖土壤沉积物的链霉菌(Streptomyces sp.)YH02全基因组测序和比较基因组特征
《微生物学报》2025年第3期1053-1069,共17页李珍华 王佳欣 张琳婕 孙宇佳 田蓉 杨瑾 刘缙 
山西省基础研究计划(自由探索类)(20210302124526,202203021212176);山西省高等学校科技创新项目(2021L472);运城学院博士科研启动项目(YQ-2020027)。
【目的】链霉菌(Streptomyces sp.) YH02是从山西运城盐湖土壤沉积物中分离的一株革兰氏阳性放线菌。解析菌株YH02的全基因组序列信息,探究其在种属进化关系中的位置,深入挖掘其次级代谢产物基因资源。【方法】利用Illumina和Pac Bio平...
关键词：链霉菌 全基因组测序 次级代谢合成基因簇 比较基因组 
典型冶金微生物Acidiphilium的比较基因组研究
《生物学杂志》2025年第1期48-54,共7页李星 娄伟 黎亮志 尹华群 徐习中 夏令 孟德龙 
国家重点研发计划项目(2023YFE0114500);湖南省自然科学基金项目(2023JJ30658)。
酸性矿山废水(acid mine drainage,AMD)是一种寡营养、低pH以及富含重金属离子的极端酸性生境。该生境中含有大量的嗜酸、耐酸微生物,是系统中碳、氮和硫等物质循环的主要驱动者。Acidiphilium属菌株为兼性异养微生物,在AMD生境中丰度小...
关键词：酸性矿山废水 Acidiphilium 环境适应机制 比较基因组学 基因水平转移 
诱变高产菌株戊糖片球菌C282中差异基因的鉴定及代谢关键蛋白的鉴定
《青岛科技大学学报(自然科学版)》2025年第1期49-59,共11页林一 杨梓璐 王天铭 陆佳雯 汪立平 
国家重点研发计划“蓝色粮仓”项目(2020YFD0900905);2019年教育部高等教育司第二批产学合作协同育人项目(201902187007).
为获得高产细菌素菌株,对高产突变菌株进行全基因组测序分析,以探究菌株高效产细菌素的分子机制。将原始菌株戊糖片球菌C-2-1进行多轮紫外诱变处理,突变菌株利用二代测序平台进行测序,然后进行组装和功能注释。组装得到的全基因组序列...
关键词：细菌素 戊糖片球菌 紫外诱变 比较基因组学 全基因组测序 
猪肺炎支原体强弱毒株的生物学特性及比较基因组学分析
《畜牧兽医学报》2025年第2期851-859,共9页李真亚 刘洁 李允 王飞 孔嫄嫄 李泳 贾荣玲 
河南省高等教育教学改革研究与实践重大项目(2021SJGLX652)。
旨在为更好地理解猪肺炎支原体(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)强弱毒株在物质代谢、毒力变化的差异,本研究基于Mhp强毒株ES-2株及其传代致弱株ES-2L株,开展二者的生长特性、黏附细胞能力、代谢产生过氧化氢水平、生物被膜形成能力等生...
关键词：猪肺炎支原体 毒力 比较基因组学 生物被膜 
新疆喀什地区人体肠道共栖菌瘤胃联合乳杆菌菌株的遗传差异及益生特性比较分析
《食品科学》2025年第3期11-19,共9页尹彤 安美玲 梁智璇 卢严砖 孙海龙 倪永清 
新疆生产建设兵团南疆重点产业创新发展项目(2022DB008);新疆生产建设兵团重点领域科技攻关项目(2023AB050);NSFC-新疆联合基金重点项目(U1903205)。
本研究以从健康家庭人体粪便样品中分离出的16株瘤胃联合乳杆菌(Ligilactobacillus ruminis)菌株为研究对象,在分析其基因组、系统发育特征的基础上,对菌株的体外益生特性进行比较分析。基因组分析表明,L.ruminis菌株的平均基因组大小...
关键词：瘤胃联合乳杆菌 比较基因组学 基因型 益生特性 
黄颡鱼源致病性嗜水气单胞菌A01的分离鉴定、全基因组特征及比较基因分析
《广东农业科学》2025年第2期82-94,共13页高玮 邵玲 
上海市农业科技创新项目(沪农科[T2024205]);上海市青年科技启明星计划(21QA1408300);上海市自然科学基金(21ZR1457800)。
[目的]解析从上海市某规模化养殖场患病黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)肝脏分离的致病性嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的基因组特征、毒力及耐药基因水平,为病原学研究以及疾病防治提供理论支持。[方法]从患病黄颡鱼体内分离纯...
关键词：黄颡鱼 嗜水气单胞菌 全基因组测序 毒力基因 耐药基因 比较基因组学 
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