全基因组测序

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重庆市食源性肯塔基沙门菌病原分析
《公共卫生与预防医学》2025年第3期17-21,共5页王文斟 罗争 李志峰 王红 赵婷 段刚 廖春艳 王玲 聂术君 
重庆市自然科学基金项目(CSTB2022NSCQ-MSX0853)。
目的 对13株肯塔基沙门菌生化和血清型复核,并进行溯源、药敏检测、耐药及毒力基因分析,了解肯塔基沙门菌的传播方式、耐药及毒力情况,为防控提供依据。方法 使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴定并按国标法进...
关键词：肯塔基沙门菌 飞行时间质谱 脉冲场电泳 全基因组测序 毒力岛 耐药基因 
去甲基甲基萘醌菌LLJ775的全基因组测序和比较基因组学分析
《中国海洋大学学报(自然科学版)》2025年第5期70-86,共17页孙凯 尹福 刘莉君 王双 张晓华 于敏 
国家自然科学基金项目(41976137,92251303,U1706208)资助。
为了探究在冲绳海槽热液区中分离得到的一株新型去甲基甲基萘醌菌(Demequina sp.)LLJ775在海洋极端环境下的代谢机制与次级代谢产物合成能力,本研究对该菌株及同属参考菌株进行了比较基因组学分析。首先采用全基因组测序得到去甲基甲基...
关键词：冲绳海槽 深海热液区 去甲基甲基萘醌菌LLJ775 全基因组测序 比较基因组学分析 
成都市预包装即食冷藏熟肉制品中单核细胞增生李斯特氏菌污染特征和致病潜力研究
《中华预防医学杂志》2025年第4期443-450,共8页刘肖 孙宏虎 刘丽莎 王翔 李少艇 张鑫昊 李澜奇 白莉 
目的分析成都市预包装即食冷藏熟肉制品中单核细胞增生李斯特氏菌(LM)的污染特征和致病潜力。方法2022年9月到2023年5月,从成都市6个区县采集预包装即食冷藏熟肉制品,开展LM定性和定量检测,对分离菌株开展全基因组测序,选取不同ST型菌...
关键词：监测 单核细胞增生李斯特氏菌 即食熟肉制品 全基因组测序 黏附和侵袭 
一株蛙源几丁质分解菌JD-3的分离鉴定、全基因组测序及功能分析
《微生物学报》2025年第4期1571-1586,共16页王蕊 林星荣 王婉婷 沈迎芳 张湑泽 
国家自然科学基金(32360260);青海省自然科学基金(2020-ZJ-965Q);青海省昆仑英才项目(QHKLYCGDCXCY-2023-138);青海民族大学校级规划项目(ESDYJ24);青海民族大学产教融合研究生联合培养基地建设项目;青海民族大学校级教学成果培育项目。
【目的】从两栖动物肠道中分离并筛选能够有效分解几丁质的菌株,研究其发酵条件、酶学特性,并进行细菌全基因组测序及功能分析。【方法】对高原林蛙肠道内容物进行筛选,分离出1株具有产几丁质酶能力的菌株,并进行形态学和分子生物学鉴定...
关键词：高原林蛙 肠道微生物 几丁质分解菌 产酶条件优化 细菌全基因组 
2023年银川市淋球菌药物敏感性及多抗原测序基因分型
《中国初级卫生保健》2025年第4期55-58,共4页杨丽娟 沈梅 刘翔 魏琼 李娜 曹守勤 马学旻 
宁夏回族自治区卫生健康系统科研课题(2022-NWKY-042)。
目的:监测2023年银川市淋球菌对7种抗生素的耐药趋势及淋球菌多抗原基因分型,为临床有效选择抗生素提供实验室依据。方法:收集淋球菌临床分离菌株21株,采用琼脂稀释法检测其对7种常用抗生素的药物敏感性;基于全基因组测序技术预测耐药...
关键词：淋球菌 药物敏感性 全基因组测序 耐药表型 淋球菌多抗原序列分型 
新生儿科溶血性葡萄球菌导管相关血流感染的溯源调查与防控
《海南医学》2025年第8期1179-1182,共4页刘丽君 牛俊 郑文萍 刘洋 林楚楚 
目的调查新生儿科溶血性葡萄球菌导管相关血流感染情况,分析导致院内感染的原因,为感染防控提供参考依据。方法采集2024年6月13~16日某综合医院新生儿科连续发生的3例溶血性葡萄球菌导管相关血流感染患儿静脉血培养菌株、病区物表采样...
关键词：溶血性葡萄球菌 导管相关血流感染 全基因组测序 多位点序列分型 
1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析
《畜牧与兽医》2025年第4期60-70,共11页沈学怀 赵瑞宏 尹磊 侯宏艳 戴银 胡晓苗 殷冬冬 王洁茹 潘孝成 周学利 刘永杰 
安徽省重点研究与开发计划项目(202204c06020039);国家蛋鸡产业技术体系项目(CARS-40);安徽省农业科学院平台项目(2024YL016);安徽省家禽产业技术体系项目(AHCYJSTX-06)。
鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病,还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌,命名为SM24,评价该菌株的生长曲线,测定菌株致病性和半数致死量(LD50),用Kirby-Bauer法对分离株进行...
关键词：鸡源印第安纳沙门菌 致病性 耐药性 毒力基因 耐药基因 全基因组测序 
下一代测序技术在乳品质量与安全中的应用研究进展
《乳业科学与技术》2025年第2期40-46,共7页陈万义 钟福霞 刘晓燕 姚璐 居万涛 
2021年江苏省“双创博士”项目(JSSCBS20210738)。
下一代测序(next generation sequencing,NGS)技术是在一代测序技术基础上于21世纪初发展起来的一种高通量测序方法。NGS具备高通量、高准确度和丰富的遗传数据信息量,因此逐步应用于乳制品工业领域,在确保乳品质量与安全方面发挥重要...
关键词：下一代测序 全基因组测序 宏基因组 乳制品质量与安全 
基于全基因组测序的多粘类芽孢杆菌NBmelon-1生防机制探究及验证
《华中农业大学学报》2025年第2期200-211,共12页董文杰 郝芳敏 臧全宇 马二磊 丁伟红 王毓洪 
宁波市科技局重点研发计划暨“揭榜挂帅”项目(2023Z115);浙江省西甜瓜良种育繁推科技创新平台项目(ZJ2019-80);国家西甜瓜产业技术体系建设专项(CARS-25)。
为研究多粘类芽孢杆菌NBmelon-1的抑菌促生机制,采用三代PacBio测序技术进行全基因组测序,分析潜在的功能基因以及预测次级代谢产物合成基因簇等;检测抑菌促生相关基因的表达情况;利用粗提物拮抗试验明确抑菌物质的主要成分,并验证该菌...
关键词：多粘类芽孢杆菌 全基因组 次级代谢产物 抑菌作用 
利用全基因组重测序分析雅安奶山羊遗传多样性和遗传结构
《四川农业大学学报》2025年第2期444-451,共8页郭家中 张一菲 武国 孙学良 杨舒慧 张红平 
四川省自然科学基金(2023NSFSC0232)。
【目的】旨在利用全基因组测序技术探究雅安奶山羊群体遗传多样性和遗传结构,为该品种的保护与利用提供参考。【方法】对20只雅安奶山羊开展全基因组测序,并使用关中奶山羊、萨能奶山羊、川中黑山羊和成都麻羊的测序数据,在全基因组内检...
关键词：奶山羊 全基因组测序 遗传多样性 基因组近交系数 遗传结构 
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