蛋白质中strand-loop-strand模体的分类  

THE CLASSIFICATION OF STRAND-LOOP-STRAND MOTIFS IN PROTEINS

作　　者：高苏娟[1] 胡秀珍[1] 

机构地区：[1]内蒙古工业大学理学院,呼和浩特010051

出　　处：《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2009年第1期24-30,共7页Journal of Inner Mongolia University of Technology：Natural Science Edition

基　　金：内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY08059)

摘　　要：从蛋白质一级序列出发,以氨基酸紧邻关联为参数,用离散量的方法,采用5交叉检验,对蛋白质中的strand-loop-strand模体进行了分类.文中使用了两个数据库,采用了不同的截取方式和序列模式长,均得到了较好的预测效果.Based on the protein sequence,strand-loop-strand motifs of proteins are classified by use of the diversity increment algorithm and through the 5-cross validation test.Twin amino acids are chosen as information parameters.Different fixed-length patterns are taken and two datasets are applied.Fairly good results of prediction are brought about.

关 键 词：离散量 离散增量 蛋白质超二级结构 strand-loop-strand模体 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]