GSK-3抑制剂药效团模型的构建  

Pharmacophore model construction of glycogen synthase kinase-3 inhibitors

作　　者：吕杨[1,2] 蒋勇军[2] 潘善飞[1,2] 代娜[1,2] 罗海彬[3] 

机构地区：[1]浙江大学化学系,浙江杭州310027 [2]浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室,浙江宁波315104 [3]中山大学药学院,广东广州510006

出　　处：《浙江大学学报（理学版）》2012年第1期60-66,70,共8页Journal of Zhejiang University（Science Edition）

基　　金：国家自然科学基金资助项目(20803063);宁波市自然科学基金资助项目(2010A610024);科技重大专项"临床前药物代谢动力学技术平台"(2009ZX09304-003)资助

摘　　要：选择活性跨越0.08～100 000nmol.L-1的8类共30个GSK-3竞争性抑制剂小分子作为训练集,其余490个不同结构和活性的小分子作为测试集.采用Accelrys Discovery Stutio Client 2.5软件,筛选得到由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水中心、1个环芳香性和1个排除体积组成的最佳模型(Correl=0.900,Config=13.962,Δcost=90.725),采用测试集与分子对接方法对模型进行评价,表明该模型具有较强的预测能力,为进一步的数据库搜索及寻找新型GSK-3抑制剂先导物提供了依据.Pharmacophore models of glycogen synthase kinase-3 inhibitors were developed with using 3D QSAR Pharmacophore program of Discovery Stutio with a training set of 30 small compounds(IC50 values from 0.08 to 100 000 nmol·L-1) containing eight different kinds of structures.The optimal pharmacophore model(Correl=0.900,Config=13.962,Δcost=90.725) was selected by one hydrogen-bond acceptor unit,one hydrogen-bond donor unit,a hydrophobic unit,a ring aromatic unit and a excluded volume unit.The model was evaluated by other 490 inhibitors as a test set and ligand-receptor docking.The results indicate that the pharmacophore model exhibits good predictive ability,and it is able to provide helpful guidelines for designing new lead compounds of glycogen synthase kinase-3 Inhibitors.

关 键 词：gsk-3抑制剂 药效团 分子对接 抑制剂设计 

分 类 号：O641[理学—物理化学]