KPC-12型碳青霉烯酶分子进化及与β-内酰胺类药物分子对接分析  

Molecular evolution of carbapenemases KPC-12 and molecular docking analysis of β-lactams

作　　者：朱健铭 姜如金[1] 肖丹宇[1] 吴康乐[1] 孔海深[2] 

机构地区：[1]杭州市余杭区中医院检验科,311106 [2]浙江大学医学院附属第一医院检验科

出　　处：《中华临床感染病杂志》2013年第1期31-34,共4页Chinese Journal of Clinical Infectious Diseases

基　　金：国家“十一·五”科技重大专项，杭州市科技发展计划项目，杭州市卫生科技计划项目，杭州市余杭区重大科技项目

摘　　要：目的 分析KPC-12型碳青霉烯酶分子进化及其与10种β-内酰胺类药物的结合自由能.方法 根据有无碳青霉烯酶活性将A类β-内酰胺酶分为两蔟,用MEGA4.1软件中的Minimum Evolution法分析KPC-2～ KPC-13、SFC-1、SME-1、IMI-1和NMC-A型具有碳青霉烯酶活性的A类β-内酰胺酶及TEM-1和SHV-1型无碳青霉烯酶活性的A类β-内酰胺酶氨基酸序列的分子进化.根据KPC-2型晶体结构在SWISS-MODEL数据库作KPC-12型同源建模,并用ArgusLab 4.1软件中的DOCK模块做KPC-12型碳青霉烯酶与10种β-内酰胺类药物底物的分子对接,最后计算酶与底物的结合自由能(△G).结果 KPC-12型与KPC-2型分子进化最为接近.KPC-12型碳青霉烯酶与β-内酰胺类药物结合自由能下降居前3位的为青霉素G钠盐、厄他培南和氨苄西林,△G分别为-8.45149、-8.36383和-8.19326 kcal/mol；结合自由能下降排在后2位的为氨曲南和克拉维酸,△G分别为-6.50614和-6.88533 kcal/mol.结论 KPC-12型碳青霉烯酶对青霉素G钠盐、厄他培南和氨苄西林的催化能力高,而对氨曲南和克拉维酸的催化能力低.

关 键 词：Β-内酰胺类 碳青霉烯酶 KPC-12 进化 分子 分子对接 结合自由能 

分 类 号：R446.5[医药卫生—诊断学]