斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501反硝化相关基因结构及功能分析  

作　　者：燕永亮 杨剑[2] 陈立宏[2] 杨帆[2] 董杰[2] 薛颖[2] 徐星晔[2] 朱雅芳[2] 姚志健[3] 林敏[4] 王忆平[5] 金奇[1] 

机构地区：[1]中国农业大学生物学院,北京100094 [2]病毒基因工程国家重点实验室,北京100176 [3]国家人类基因组北方研究中心,北京100176 [4]中国农业科学院生物技术研究所,北京100081 [5]北京大学生命科学学院,北京100871

出　　处：《中国科学（C辑）》2005年第3期246-253,共8页Science in China(Series C)

基　　金：国家"973"计划(批准号:001CB108904);国家"863"计划(批准号:2001AA214021)资助项目

摘　　要：在A1501株的基因组上鉴定了4个反硝化相关的基因簇:nar,nir,nor和nos,共40个基因,基因的转录产物与其他种群中物质运输、基因调控以及还原酶类蛋白高度同源.nir,nor和nos基因簇在染色体上位置靠近,与nar基因簇相隔较远.与其他反硝化细菌比对的结果表明,A1501株中的40个反硝化基因组成了一套完整的反硝化催化系统.在A1501株中,该系统有以下特点:(ⅰ)nar基因簇中,narK基因只发现一个拷贝.(ⅱ)在narK与narG之间有一个narM基因.(ⅲ)在narX,narL基因的下游鉴定了两个基因dnrE和orf1,其中dnrE基因是一个属于FNR家族的转录因子.(ⅳ)A1501株中nir基因有16个,是所有已知反硝化细菌nir基因数量最多的.(ⅴ)在A1501株中,同时也是在假单胞杆菌属中首次报道norR基因.(ⅵ)nos基因簇相对保守,无论在基因组成还是排列方式与参照的菌株都完全一致.

关 键 词：功能分析 基因结构 相关 反硝化细菌 基因组成 基因簇 假单胞杆菌 nar nir nor 物质运输 转录产物 基因调控 催化系统 转录因子 基因数量 排列方式 nos 染色体 M基因 L基因 r基因 FNR E基因 dnt R基因 鉴定 种群 蛋白 

分 类 号：Q935[生物学—微生物学]