应用抑制性消减杂交技术筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白2反式调节基因  

Screening and Identification of Genes Transactivated by Nonstructural Protein NS2 of Hepatitis C Virus by Suppression Subtractive Hybridization Technique

作　　者：张黎颖[1] 成军[1] 刘妍[1] 郭江[1] 黄燕萍[1] 吴顺华[1] 吴煜[1] 邵清[1] 

机构地区：[1]北京地坛医院传染病研究所,北京100011

出　　处：《中西医结合肝病杂志》2005年第3期156-158,161,共4页Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Medicine on Liver Diseases

基　　金：国家自然科学基金(No.30371288);北京市自然科学基金(No.5042024);第35批博士后科学基金(2004035045)

摘　　要：目的:构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白2(NS2)反式调节基因cDNA消减文库,研究HCVNS2蛋白的反式调节基因。方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术筛选转染pcDNA3.1(-)NS2和空载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞差异性表达基因,并进行生物信息学分析。结果:获得12个差异表达的已知蛋白基因和3个未知功能基因序列,包括:磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(glypican3,GPC3)、酸性核糖体磷蛋白PO、核糖体蛋白L13a、整合素β1、天冬酰胺合成酶、信号肽酶、α2HS糖蛋白、小核糖体蛋白多肽G、蛋白酶样亚单位、黄体酮受体、SDR家族脱氢酶8、Ras家族RAB4A、具有BTB/POZ结构的新蛋白、具有coiled coil helix结构的新蛋白、未知功能基因。结论:成功构建HCVNS2反式调节的相关基因cDNA消减文库,为今后进一步分析、研究病毒蛋白的致病机制提供了线索。Objective:To construct a cDNA subtractive library transregulated by hepatitis C virus NS2 protein(NS2). Methods:Suppression subtractive hybridization(SSH) and bioinformatics techniques were used for screening and cloning the differently expressed gene in the HepG2 cells transfected pcDNA3.1(-)-NS2 and pcDNA3.1(-)empty vector, respectively. Results:Twelve differently expressed known genes and three unknown genes were obtained.Conclusion: The subtractive library of genes transregulated by NS2 was constructed successfully. The results showed the new information to clarify the mechanism of hepatitis C.

关 键 词：反式调节基因 抑制性消减杂交技术 丙型肝炎病毒(HCV) 筛选 CDNA消减文库 蛋白2 差异性表达基因 生物信息学分析 PCDNA3 非结构蛋白 NS2蛋白 磷脂酰肌醇 核糖体蛋白 整合素β1 黄体酮受体 RaS家族 G2细胞 基因序列 蛋白基因 

分 类 号：R373.2[医药卫生—病原生物学]