nr数据库分析及其本地化  

Integrated nr Database in Protein Annotation System and Its Localization

作　　者：邓泱泱[1] 荔建琦[2] 吴松锋[2] 朱云平[2] 陈耀文[1] 贺福初[2] 

机构地区：[1]汕头大学人工智能与模式识别实验室,汕头515063 [2]北京放射医学研究所系统生物学实验室,北京100850

出　　处：《计算机工程》2006年第5期71-73,76,共4页Computer Engineering

基　　金：国家"863"计划基金资助项目(2002-BA711A11);国家"973"计划基金资助项目(2001CB510209);北京市科技计划基金资助项目(H030230280590);国家自然科学基金委员会资助项目"创新研究群体科学基金"(321003)

摘　　要：通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。Comparing the nr database with the IPI database by using NCBI blastp program to align human protein sequences, this paper provides an evidence of necessity of integrating the nr database in the protein annotation system. Then it localizes the nr database, provides its statistical information and local service, gets the annotation information source ready for the protein annotation system.

关 键 词：蛋白质序列数据库 序列比对 蛋白质注释 本地化 

分 类 号：TP311[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]