利用遗传特征实现微生物基因序列聚类分析  

Using Genetic Characteristics to Realize Clustering Analysis for Sequential Gene Data of Microorganism

作　　者：吴君浩[1] 骆嘉伟[1] 赵蕊[2] 

机构地区：[1]湖南大学计算机与通信学院,长沙410082 [2]中南大学信息科学与工程学院,长沙410083

出　　处：《计算机工程与应用》2006年第20期164-166,共3页Computer Engineering and Applications

基　　金：湖南省自然科学基金资助项目(编号:03jjy3095)

摘　　要：文章提出了一种使用微生物遗传特征来进行基因序列聚类的方法。该方法首先从每条基因序列中划分出若干个等差长度的采样片断,然后利用各采样片断的遗传特征DNA(G+C)mol%值来作为基因序列聚类的依据。试验结果表明该方法是可行的,并且具有较好的聚类质量。This paper discusses a method to clustering sequential gene data of microorganism,using genetic characteristics.First,we divide each gene sequence into some arithmetic sample segments.Secondly,the clustering is done according as the DNA（G＋C）mol% value of the sample segltnents.The experiment results show that this method is feasible and has comparatively better clustering quality.

关 键 词：微生物 (G+C)mol% 基因序列 K-均值聚类 

分 类 号：TP311[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]