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作 者:刘敬忠[1] 向华[1] 张纪平 毛燕玲[1] 赵离钟[1] 张鹏[1] 朱章菱[1] 翁心植[1] 卢圣栋
机构地区:[1]首都医科大学附属北京红十字朝阳医院,中国医学科学院基础医学研究所,武汉市儿童医院
出 处:《高技术通讯》1996年第1期37-41,共5页Chinese High Technology Letters
摘 要:建立了适用于大批量标本基因突变筛查的双脱氧指纹图谱法即ddF。该技术集测定DNA序列的%脱氧末端终止法及SSCP二者长处于一身,即只作一个(例如用ddA)双脱氧末端终止反应,然后将反应产物在与SSCP相同的电泳条件下进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,这样有突变的样品不会漏检,阳性检出率高达100%。简化了原方法中RNA转录及逆转录等步骤,直接以PCR产物为模板,将双链DNA循环测序的反应用作ddF反应,称之为Cycle-ddF,省去了T7RNA聚合酶及MMV逆转录酶二种酶。这样,Cycle-ddF既保持了阳性检出率高的优点,又降低了成本,简化了步骤,使之便于在大多数实验室推广开展。运用Cyele-ddF技术进行了乙型血友病(HB)患者九因子基因(F Ⅸ)及β地中海贫血患者β珠蛋白基因突变的筛查。对筛查出的有异常指纹图谱的片段,进而用ABD373A-01型DNA自动测序仪有针对性地测出了具体突变点。The ddF was simplified by replacing T7 RBA transcription and MMV reverse transcriptation with a dsDNA cycle sequencing that was named cycle ddF (Cycle-dideoxy Fingerprinting). The cost of the screening test was decreased. Ninth DNA fragments of F Ⅸ gene from Hemophilia B patients and 30 DNA fragments of β globin gene from β-thalassemia were screened by using the cycle ddF technique. The DNA fragments with point mutations, were found out obviously and confirmed by DNA sequencing with ABD 373A-01 type autosequencer.
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