基于SOM网络的基因表达数据聚类分析  

Cluster Analysis of Gene Expression Data Based on SOM Network

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作  者:涂晓芝[1] 颜学峰[1] 钱锋[1] 

机构地区:[1]华东理工大学自动化研究所,上海200237

出  处:《华东理工大学学报(自然科学版)》2006年第8期992-996,共5页Journal of East China University of Science and Technology

基  金:国家自然科学基金(20506003);教育部科学技术研究重点项目(106073);上海市启明星项目(04QMX1433);国家973计划项目(2002CB3122000)

摘  要:提出了用自组织映射(SOM)网络对生物信息学中基因表达数据进行聚类分析的方法。用SOM网络对酵母基因表达数据进行聚类。通过对映射结果的分析,表明SOM网络有较高的分类正确率,用于基因表达数据的聚类分析是行之有效的。Method of analyzing gene expression data based on SOM networks are discussed. An SOM network is briefly introduced and its cluster characteristics and visualization methods are illustrated using simulation. Then the SOM network is used to cluster the yeast gene expression data. The analysis of the mapping results shows that the performance of clustering gene expression data based on the SOM network is good.

关 键 词:SOM网络 聚类分析 基因表达数据 

分 类 号:TP183[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]

 

参考文献:

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