基因表达数据

作品数：282被引量：641H指数：11
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面向基因调控网络的基因关联分析算法
《计算机工程与应用》2025年第3期155-165,共11页李志杰 廖莎 刘安丰 李青蓝 
国家自然科学基金(62072475);湖南省自然科学基金(2019JJ40111)。
基因调控网络是基于微阵列基因表达数据,对基因之间表达关系依赖程度的一种仿真或重建。从基因表达数据挖掘基因之间存在的一定程度因果关系,对重构基因调控网络具有十分重要的意义。提出一种基于频繁原子序列关联熵的基因关联分析算法...
关键词：基因表达数据 基因调控 频繁原子序列 关联熵 基因序列贝叶斯网络 
基于基因关联分析的贝叶斯网络疾病样本分类算法
《计算机应用》2024年第11期3449-3458,共10页李志杰 廖旭红 李元香 李青蓝 
国家自然科学基金资助项目(61672391);湖南省自然科学基金资助项目(2019JJ40111)。
基因表达数据作为生物学中一种特定类型的大数据,尽管基因表达值都是普通的实数值,但它们的相似性不是基于欧氏距离度量,而是基于基因表达值是否展现同升同降趋势。目前的基因贝叶斯网络以基因表达水平值为节点随机变量,没有体现这种子...
关键词：基因表达数据 频繁原子序列 基因关联熵 基因序列贝叶斯网络 疾病分类 
联合非局部自相似和张量分解的低秩张量填充算法
《高等学校计算数学学报》2024年第3期209-228,共20页胡文玉 张子长 黄进红 孟丽红 
国家自然科学基金项目(62266002,82060328,61863001,61962003);江西省自然科学基金项目(20224BAB202004,S2023ZRMSL0636,20232BAB206133,S2023ZRMSL0633,20232BAB202017);江西省社会科学基金项目(22GL26);江西省高校人文社科项目(JC21117);赣南师范大学学位与研究生教育教改研究项目(YJG-2021-13)
1引言随着大数据时代的到来,信息呈爆炸性增长,生活中每时每刻都在产生海量数据,例如贸易交易数据、用户评分数据和基因表达数据等,而这些数据通常具有复杂的高维空间结构,若采用数据的矩阵表示形式会破坏数据的重要信息从而产生较大的...
关键词：多维数据 张量分解 填充算法 评分数据 大数据时代 基因表达数据 矩阵表示 海量数据 
基于改进的深度学习模型分类乳腺癌分子亚型
《中北大学学报（自然科学版）》2024年第4期428-438,共11页段美华 焦雄 
山西省自然科学基金资助项目(202203021221063)。
由于乳腺癌的高度异质性,不同分子亚型的乳腺癌在治疗和诊断方面都有着很大的差异,因此提高乳腺癌亚型诊断的准确性,对于进一步降低乳腺癌的误诊率,避免乳腺癌的过度治疗具有重要的意义。基于深度学习算法对TCIA数据库中的MRI乳腺癌医...
关键词：深度学习 乳腺癌分子亚型 传统机器学习 数据增强 基因表达数据 
基于H&E图像和基因表达数据的多模态深度学习模型预测胃癌生存风险
《软件工程》2024年第8期37-40,共4页马艳雨 贺平安 
胃癌作为高发恶性肿瘤,其致死率近年来居高不下,因此精准预测胃癌患者的生存风险对于治疗至关重要。文章提出了一种基于多模态深度学习的预测模型,旨在评估胃癌患者的生存风险。该模型整合了H&E(Hematoxylin-Eosin staining)染色图像和...
关键词：胃癌 H&E染色图像 基因表达 深度学习 多模态 
基于药理学分析巴戟天治疗阿尔茨海默病的机制被引量：1
《食品工业科技》2024年第16期36-46,共11页丁其莹 刘鑫源 覃佳运 吴永雷 肖连臣 周兰庭 李珍珍 
国家自然科学基金(82301374);湖北省自然科学基金(2022CFB572);湖北文理学院教师科研能力培育基金(2021kpgpzk03);湖北文理学院大学生创新创业训练计划项目(S202310519048);湖北文理学院神经科学与脑科学研究所开放课题(2023NBI07)。
目的:基于网络药理学、分子对接和GEO数据分析巴戟天治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的潜在靶点和作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取巴戟天的主要活性成分,用SwissTargetPrediction获取巴戟天...
关键词：巴戟天 阿尔茨海默病 整合药理学 分子对接 基因表达数据分析 
血管样本生物信息学分析鉴定烟雾病相关的潜在关键基因
《中国卒中杂志》2024年第4期431-439,共9页刘洋 杨俊华 吴俊 王硕 
目的本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制。方法本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象。利用R语言线性模型微阵...
关键词：烟雾病 生物信息学分析 基因表达数据 枢纽基因 
人工智能在肿瘤基因表达数据中的应用研究进展被引量：1
《中国医学物理学杂志》2024年第3期389-396,共8页李坤鹏 王泽朋 周玉 李四海 
甘肃省科技计划项目(21JR1RA272);甘肃省教育厅-高校教师创新基金(2023B-105);甘肃省自然科学基金(22JR5RA606)。
肿瘤是影响人类健康的严重疾病,早期诊断对提高治疗成功率和患者生存率至关重要。肿瘤基因表达数据的研究已经成为揭示肿瘤疾病机制的主要工具,人工智能在肿瘤基因表达数据分析中扮演着重要角色。本文从机器学习方法的角度,探讨监督式...
关键词：基因表达数据 人工智能 机器学习 特征选择 综述 
一种CCA-层次聚类的基因聚类算法
《哈尔滨理工大学学报》2023年第5期85-90,共6页林倩闽 
福建省科技厅引导性项目(2019H0039);福建省中青年教师教育科研项目(JAT210341)。
针对基因芯片技术带来的海量基因表达数据,为了充分挖掘其蕴含的生物信息和潜在的生物机制,提出一种基于CCA-层次聚类的基因聚类算法(CCA-Hc)。该算法在层次聚类的基础上引入典型相关分析,优化相似性矩阵计算方法。首先,利用典型相关分...
关键词：基因表达数据 聚类算法 典型相关分析 层次聚类 
基于Charm算法挖掘基因表达保序子序列
《现代计算机》2023年第14期8-13,共6页廖旭红 江华 廖莎 李志杰 
湖南省自然科学基金(2019JJ40111)。
保序子序列(OPSS)是基因表达数据重要的定性测度双聚类方法,通常将基因实数表达值排序后替换成相应的列标签,OPSS的部分行在部分列下同升同降。提出一种基于Charm算法的保序子序列挖掘方法Charm_Seq,将Charm由频繁闭合项集挖掘改造为频...
关键词：基因表达数据 双聚类 保序子序列 CHARM 序列挖掘 
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