基因表达数据分析

作品数：35被引量：97H指数：4
导出分析报告
相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
相关作者：李康武晓岩朱婵孔薇崔光照更多>>
相关机构：华中科技大学江南大学哈尔滨医科大学暨南大学更多>>
相关期刊：《重庆医学》《北京邮电大学学报》《软件学报》《计算机工程》更多>>
相关基金：国家自然科学基金上海市教育委员会创新基金上海市青年科技启明星计划广东省自然科学基金更多>>
-
在结果中检索

检索结果分析

结果分析中...
共 条 记 录，以下是1-10
全选清除导出
参考文献引证文献引用追踪
视图：
排序：
基于药理学分析巴戟天治疗阿尔茨海默病的机制被引量：1
《食品工业科技》2024年第16期36-46,共11页丁其莹 刘鑫源 覃佳运 吴永雷 肖连臣 周兰庭 李珍珍 
国家自然科学基金(82301374);湖北省自然科学基金(2022CFB572);湖北文理学院教师科研能力培育基金(2021kpgpzk03);湖北文理学院大学生创新创业训练计划项目(S202310519048);湖北文理学院神经科学与脑科学研究所开放课题(2023NBI07)。
目的:基于网络药理学、分子对接和GEO数据分析巴戟天治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的潜在靶点和作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取巴戟天的主要活性成分,用SwissTargetPrediction获取巴戟天...
关键词：巴戟天 阿尔茨海默病 整合药理学 分子对接 基因表达数据分析 
基于SIS的基因表达数据分析被引量：2
《长春工业大学学报》2017年第5期417-420,共4页王福友 白冰 徐平峰 
国家自然科学基金资助项目(11401047;11571050);吉林省科技厅发展计划基金资助项目(20140520059JH)
用SIS方法对36位白血病患者中7 126个基因的高维数据进行降维,结合Lasso变量选择方法选出可能的致病基因。根据响应变量的数据类型建立了广义线性模型(Logistic模型)。通过比较AIC&BIC准则以及CV交叉验证方法下的拟合概率图得出最优模型。
关键词：高维数据 变量选择 SIS方法 Lasso 
基于SVM的肿瘤特征基因提取与基因表达数据分析被引量：3
《重庆理工大学学报（自然科学）》2016年第6期102-108,共7页谭云 于彬 王琦然 王学敏 李珊 邱文莹 
国家自然科学基金资助项目(41204115);山东省自然科学基金资助项目(ZR2013AM007;ZR2014FL021);山东省高等学校科技计划项目(J13LI54)
提出一种基于支持向量机的肿瘤基因表达谱数据挖掘方法。首先采用信噪比方法对白血病、结肠癌、肺癌数据提取特征基因,生成特征基因子集。然后通过支持向量机分类模型对特征基因子集进行机器学习训练分类。实验结果表明:急性白血病、结...
关键词：基因表达谱 肿瘤分类 特征基因 信噪比 支持向量机 
产电微生物基因调控网络的构建和特异性通路分析被引量：1
《中国生物工程杂志》2014年第11期42-46,共5页徐军 刘翠翠 丁德武 孙啸 谢建明 
研究产电微生物胞外电子传递过程和机制,发现与产电效率相关的关键基因、通路和代谢物,是微生物燃料电池研究中的关键技术。为了发现在胞外电子传递过程中起到关键作用的基因以及通路,首先利用比较基因组学的方法,以模式微生物大肠杆菌...
关键词：产电微生物 胞外电子传递 基因转录调控网络 基因表达数据分析 
基于矩阵分解技术的显著基因提取及基因表达数据分析
《生物医学工程学杂志》2014年第3期662-670,共9页孔薇 王娟 牟晓阳 
国家自然科学基金资助项目(61271446);上海市科委青年科技启明星计划(A类)资助项目(11QA1402900);上海市教委科研创新项目资助(11YZ141)
基因之间存在多种多样的表达调控活动,一般认为这些调控关系隐含在基因表达谱中。因此,可以根据基因表达数据对基因调控状态进行建模,以挖掘具有生物学意义的信息及隐含在其中的基因调控关系。本文分别利用独立成分分析(ICA)和非负矩阵...
关键词：矩阵分解 微阵列基因表达数据 独立成分分析 非负矩阵分解 阿尔茨海默病 
谱聚类算法在基因表达数据分析中的应用被引量：1
《现代计算机》2014年第6期8-12,24,共6页邓小燕 甘晓玲 唐宜 
基因表达数据的爆炸性增长迫切需要一种自动而有效的聚类分析工具。因此,将谱聚类算法应用于基因表达数据的分析,并针对基因表达数据的特点对谱聚类算法进行改进。同时,还提出一个聚类效果外部评价指标ARI,用该指标与经典的内部评价指标...
关键词：谱聚类算法 基因表达数据 评价指标 
基于大脑不同区域的阿尔茨海默症基因表达数据分析被引量：2
《上海交通大学学报》2013年第6期994-997,1002,共5页孔薇 牟晓阳 
国家自然科学基金项目(61271446);上海市科委青年科技启明星计划(A类)项目(11QA1402900);上海市教委科研创新项目(11YZ141)
提出了采用Tukey双权函数作为FastICA(Fast Independent Component Analysis)方法的非线性函数,对阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)多个脑区域基因表达数据进行显著基因提取,揭示其基因表达调控关系.针对传统聚类方法基于全局聚...
关键词：微阵列基因表达数据 阿尔茨海默症 独立成分分析 基因调控网络 
基于矩阵变换的层次聚类在基因表达数据分析中的应用研究
《计算机光盘软件与应用》2012年第24期46-47,58,共3页王祥林 
随着基因测序技术的不断发展和完善,基因芯片技术逐渐成熟,产生了大量可供分析的基因表达数据,使得研究和比较大量基因成为了可能。聚类分析能够检测出表达谱相似的基因群,将基因表达谱相似程度高的基因划分到同一类中,从而识别出未知...
关键词：层次聚类 基因芯片 基因表达数据 
基于非负矩阵分解的大脑不同区域基因表达数据分析被引量：1
《中国生物医学工程学报》2012年第6期875-881,共7页孔薇 陶伟杰 牟晓阳 
国家自然科学基金(61271446);上海市科委青年科技启明星计划(A类)(11QA1402900);上海市教委科研创新项目(11YZ141)
基因之间存在多种多样的表达调控活动,一般认为这些调控关系隐含在基因表达谱中。针对阿尔茨海默症(AD)起病隐匿、诊断难、发病机理复杂以及基因信号传导通路和调控关系难以重建等特征,利用非平滑非负矩阵分解(nsNMF)方法提取AD致病基因...
关键词：微阵列基因表达数据 非负矩阵分解 阿尔茨海默病 
基于小波去噪和改进的FCM算法的基因表达数据分析被引量：3
《计算机与应用化学》2011年第7期951-953,共3页陈刚 陆媛 杨慧中 
国家自然科学基金资助项目(60674029);江苏省高技术研究项目(BG2006010);上海市科学技术委员会的资助(09DZ2273400)
模糊c均值算法是一种局部搜索迭代法,易陷入局部最小解,而且算法未考虑样本对聚类的贡献程度。针对传统的模糊c均值(FCM)算法的不足和基因表达数据高噪声的特点,提出了一种基于小波变换和改进的FCM聚类模型,最后将该模型应用于白血病基...
关键词：基因表达数据 小波变换 改进的FCM聚类 样本聚类 
全选清除导出
共4页<1234>
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部