基因组AFLP分析及线粒体12S rRNA序列变异在笛鲷科系统发育上的比较  被引量:2

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作  者:张俊彬[1] 刘昕[1] 

机构地区:[1]中国科学院广东省海洋应用生物技术重点实验室中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境动力学开放实验室,广州510301

出  处:《科学通报》2006年第B11期120-124,共5页Chinese Science Bulletin

基  金:国家自然基金项目(批准号:40306022);广东省自然科学基金项目(编号:04001300)资助.

摘  要:以10种笛鲷科鱼类和1种纵带裸颊鲷为对象,采用ABI PRISM 310测序仪进行基因组AFLP分析,并结合线粒体12S rRNA序列变异对笛鲷科系统发育开展比较研究.结果显示:除了紫鱼属和梅鲷属鱼类外,这两种方法构建的最小进化树(ME)的拓扑结构基本上是一致的,而且具有较高的自展值(bootstrap),其揭示的笛鲷科系统发育关系也为最大似然法(ML)支持.基于线粒体12S rRNA序列进行最大似然法分析表明,笛鲷科系统发育最适合的替代模型为TrN+G,对数似然比检验表明,分子钟是被接受的.AFLP遗传标记适合于笛鲷科及以下水平的系统发育分析.研究表明,笛鲷属可能为一单系,但其他属的系统发育关系还需要更多资料进一步验证.

关 键 词:笛鲷科 系统发育 基因组 线粒体 12S RRNA AFLP 

分 类 号:Q951[生物学—动物学] Q953

 

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