序列比较分析揭示水稻Pms1区段基因组的快速进化  

作　　者：於金生[1] 范优荣[1] 刘南[1] 山燕[1] 李香花[1] 张启发[1] 

机构地区：[1]作物遗传改良国家重点实验室,国家植物基因研究中心(武汉),武汉430070

出　　处：《科学通报》2007年第5期540-547,共8页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA10A103);国家自然科学创新群体基金(批准号:30321005)资助项目

摘　　要：以前的研究将水稻光敏核不育位点Pms1定位在第7染色体上.本研究对来源于定位亲本(明恢63和农垦58)的两个BAC克隆进行比较测序,以鉴定Pms1的候选基因;并通过对两个克隆的注释和比较得到5个候选基因,以进行进一步的功能检验.将这两个亲本的基因组序列与公共数据库里的日本晴和93-11比较分析,结果显示,该区段4个亲本在序列组成上存在巨大差异,这种差异主要归咎于活性反转座成分造成的基因组新近增长和变异;亚种内和亚种间以Indel或者SNP的形式存在高度的多态性.利用反转座成分的两个长末端重复进行分析发现,它们的替换速率比已有的报道要高得多.该结果证明,在自然和人工选择的共同作用下,Pms1区段正处于快速的基因组进化过程中.

关 键 词：光敏感雄性核不育 基因组结构 反转录转座子 插入年代估计 选择 

分 类 号：S511[农业科学—作物学]