反转录转座子

作品数：113被引量：332H指数：13
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年轻的LINE1重塑干细胞命运
《科学通报》2023年第35期4740-4742,共3页赵欣 吕鑫屹 
天津市自然科学基金青年项目(21JCQNJC00010)的资助
反转录转座子是通过将RNA中间体反转录成cDNA,以“复制和粘贴”机制在基因组中进行转座的DNA重复序列,在基因组稳定性和物种多样性中发挥重要作用[1].反转录转座子种类丰富,占小鼠基因组的40%左右[2].尽管大多数反转录转座子在漫长进化...
关键词：反转录转座子 反转座子 DNA重复序列 干细胞 转座活性 小鼠基因组 转座元件 物种多样性 
ELL3通过LINE-1调节小鼠细胞原始多能性
《科学通报》2023年第33期4433-4435,共3页常展赫 朱学昊 高绍荣 高亚威 
人类基因组中有超过50%的序列是转座子序列(transposon elements,TE).转座子又称跳跃基因,是一类可以在基因组中进行自我复制和粘贴的DNA元件[1].转座子主要分为DNA转座子和反转录转座子,其中反转录转座子会先转录产生RNA,再反转录成DN...
关键词：反转录转座子 人类基因组 跳跃基因 自我复制 转座元件 多能性 小鼠细胞 
四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析
《分子植物育种》2023年第21期6972-6981,共10页蔡铁城 张冲 刘菁 阳太亿 陈华 蒋菁 贺梁琼 韩柱强 唐荣华 庄伟建 刘俊仙 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960409;32072103;31960416);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027;2018GXNSFDA294004;2020GXNSFAA297081)共同资助。
本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachi...
关键词：花生 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 异质性 四倍体野生种 
小麦幼苗活性LTR反转录转座子筛选及其对非生物胁迫的响应被引量：1
《作物学报》2023年第4期966-977,共12页周宾寒 杨竹 王书平 方正武 胡赞民 徐兆师 张迎新 
国家重点研发计划项目(2017YFD0100800);国家转基因生物新品种培育重大专项(2018ZX0800909B);湖北省重点研发计划项目(2022BBA0035);湖北省科学技术重大创新专项(2018ABA085)资助。
LTR(长末端重复,long terminal repeat)反转录转座子占小麦基因组的60%以上,筛选小麦基因组中具有转座活性的LTR反转录转座子,并分析其在非生物胁迫下的响应,对研究反转录转座子在小麦抗逆境胁迫中的作用具有重要意义。本研究通过生物...
关键词：小麦 非生物胁迫 LTR反转录转座子 相对表达水平 转座 
基于SINE-RIPs标记的苏姜猪群体结构和遗传多样性分析被引量：1
《中国畜牧杂志》2023年第2期147-154,共8页迟诚林 倪黎纲 陶勇 陈才 周春宝 宋成义 王宵燕 
江苏省种业振兴“揭榜挂帅项目”[JBGS(2020)028];国家自然科学基金(31872977,32002146);江苏省博士后科研资助计划(2021K221B);江苏省农业科技自主创新资金[CX(19)2016]。
为了探究苏姜猪群体遗传结构与遗传多样性,本研究采用36个SINE-RIPs(SINE Retrotransposon Insertion Polymorphisms)标记检测苏姜猪育种核心群体的基因多态性,并分析群体的遗传参数,构建UPGMA(Unweightedpair Group Method Arithmeticm...
关键词：反转录转座子插入多态 苏姜猪 SINE 群体结构 
盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒反转录转座子及卫星DNA序列的同源克隆与分析
《分子植物育种》2022年第17期5667-5674,共8页彭亚萍 陈博 张燕 宋美妮 汪军成 姚立蓉 孟亚雄 马小乐 李葆春 王化俊 
国家大麦青稞产业技术体系项目(CARS-05-03B-03);国家自然科学基金项目(31960072,32001514);甘肃省自然基金重点项目(20JR10RA507);国家973前期研究专项(2014CB160313);国家级大学生创新创业训练计划项目(202010733004);盛彤笙科技创新基金项目(GSAU-STS-1513)共同资助。
为研究藜科(Chenopodiaceae)植物盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒区域反转录转座子及卫星DNA序列的组成,并探讨盐生草、甜菜(Beta vulgaris L.)、藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)这三种藜科植物着丝粒反转录转座子及卫星DNA序列的...
关键词：盐生草 着丝粒 反转录转座子 同源克隆 序列比对 
冬青卫矛LTR反转录转座子RT序列克隆及分析
《山地农业生物学报》2022年第3期1-6,27,共7页贺诗琪 范付华 吴宇航 龙蓉 王君荣 陈美吉 
贵州省一流学科建设项目(GNY[2017]007);贵州大学大学生“SRT计划”项目(贵大SRT字[2019]266)。
本文以冬青卫矛基因组DNA为模板,克隆LTR反转录转座子Ty1-copia类与Ty3-gypsy类反转录酶(reverse transcriptase,RT)序列,通过测序及相关生物信息学软件对所获序列变化特点进行分析。最终获得Ty1-copia与Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列...
关键词：冬青卫矛 LTR反转录转座子 反转录酶 异质性 
BB染色体组野生种花生LTR反转录转座子RT基因的多样性分析
《植物科学学报》2022年第1期54-65,共12页熊发前 刘菁 韩柱强 阳太亿 唐秀梅 唐荣华 钟瑞春 蒋菁 贺梁琼 吴海宁 黄志鹏 刘俊仙 
国家自然科学基金项目(31960409,31960416);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027,2018GXNSFDA294004,2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2018YM06,桂农科2017JZ13,桂农科31960409,桂农科2021YT052)。
利用简并PCR技术从野生花生种(Arachis ipaensis Krapov.et W.C.Greg.)的基因组中扩增分离Ty1-copia类(1类)和Ty3-gypsy类(2类)反转录转座子RT基因,并对其序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性进行分析。结果显示:对于1和2类RT基因...
关键词：花生 野生种 LTR反转录转座子 反转录酶 多样性 
果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析
《南方农业学报》2022年第2期287-298,共12页刘俊仙 阳太亿 刘菁 张荣华 卢曼曼 雷敬超 高轶静 丘立杭 李松 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960416);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA294004,2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科31960416)。
【目的】分析Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶基因(RT)序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性,为深入研究果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列、转录转座活性及生物学功能提供理论参考。【方法】以果蔗品种拔地拉为试材,根据Ty3-g...
关键词：果蔗 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 拔地拉 多样性 
AA野生种花生Ty1-copia类反转座子RT基因的克隆与序列分析
《广西植物》2022年第1期100-112,共13页蔡铁城 刘俊仙 张冲 刘菁 阳太亿 蒋菁 贺梁琼 韩柱强 唐荣华 庄伟建 熊发前 
国家自然科学基金(31960409,32072103,31960416);广西自然科学基金(2018GXNSFDA281027,2018GXNSFDA294004,2020GXNSFAA297081);福建省科技厅农业引导性(重点)项目(2018N0004);广西农业科学院科技发展基金(桂农科2018YM06,桂农科2017JZ13,桂农科31960409,桂农科2021YT052)。
该研究旨在克隆Ty1-copia类反转录转座子RT(reverse transcriptase)基因,为分离花生属Ty1-copia类反转录转座子全长序列和研究其功能提供序列基础。根据RT基因的保守区设计简并引物,以两份AA染色体组野生种花生Arachis duranensis为试材...
关键词：花生 Ty1-copia 类反转录转座子 反转录酶 野生种 异质性 
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