回交、DH和RIL偏分离群体遗传图谱的重新构建  

作　　者：朱成松[1] 王付华[1] 王建飞[1] 李广军[1] 张红生[1] 章元明[1] 

机构地区：[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京210095

出　　处：《科学通报》2007年第8期918-922,共5页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB101708);国家自然科学基金(批准号:30470998;30671333);江苏省自然科学基金(批准号:BK2005087);教育部"长江学者和创新团队发展计划"和新世纪优秀人才支持计划(批准号:NCET-05-0489);国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA10Z1E5);教育部与人事部留学回国人员基金;南京农业大学人才基金资助项目

摘　　要：分子标记偏离孟德尔分离比例(称偏分离)是一种普遍的生物学现象.虽然偏分离可能会影响标记间遗传距离的估计值和数量性状基因座(quantitative traitlocus,QTL)定位结果,但在遗传连锁图构建和QTL定位中偏分离的影响常常被忽视.在分子标记存在偏分离、显性和缺失情况下,根据隐马尔可夫模型,我们已发展了一种新的多点方法来重新构建F2群体分子标记连锁图,以解决偏分离对标记连锁图构建的影响.本文简化了上述方法以适用于回交、加倍单倍体和重组自交系群体.模拟研究表明:(ⅰ)两连锁偏分离基因座(segregation distortion locus,SDL)影响标记间遗传距离的程度随SDL遗传率和标记间遗传距离的增加而增加,但受样本容量的影响较小;(ⅱ)两连锁SDL一般会低估标记间遗传距离,但是,加性模型下两个SDL加性效应符号相反时会高估之,上位性模型下两SDL加性×加性效应为负时却不影响其估计;(ⅲ)用本文的方法均能矫正遗传距离估计值的偏差.将新发展的方法应用于已构建的一个存在严重偏分离的水稻(Oryza sativa L.)籼粳杂交组合IR28×大关稻的F7代重组自交系群体,重新构建了分子标记遗传图谱,并用Bootstrap法获得了遗传距离的95%置信区间.这些结果进一步印证了本文发展的新方法.这为数量性状和生活力性状的遗传分析提供了基础.为实际数据分析研制的DistortedMap计算机软件可供利用1).

关 键 词：分离群体 偏分离 遗传图谱 生活力选择 EM算法 

分 类 号：Q3[生物学—遗传学]