基于GM(1,1)模型的蛋白质二级结构类型预测  

Predict protein structural classes based on GM(1,1) modeling

作　　者：林卫中[1] 肖绚[1] 

机构地区：[1]景德镇陶瓷学院信息工程学院,江西景德镇333403

出　　处：《计算机工程与应用》2007年第34期41-42,45,共3页Computer Engineering and Applications

基　　金：国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60661003);江西省自然科学基金(the Natural Science Foundation of Jiangxi Province of China under Grant No.0611060)。

摘　　要：蛋白质二级结构类型预测是当今生物信息学研究的热点之一。利用氨基酸数字编码模型将氨基酸序列转换成数字信号,得出此蛋白质的GM(1,1)模型参数,并将这些参数作为伪氨基酸成分,由于这些伪氨基酸成分具有描述氨基酸序列的总体特征的特点,使得预测成功率有较大的提高。Protein secondary structure prediction is the hot of bioinformatics.By using digital encoding,amino acid sequence will be converted into digital signals,and the protein GM（1,1） model parameters which are used as a pseudo-amino acid composition are got.As a result of these pseudo-amino acids is described amino acid sequence of the overall characteristic,a prediction success rate is improved largely.

关 键 词：蛋白质 二级结构型预测 GM(1 1)模型 

分 类 号：TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术]