H5N1亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析  

作　　者：张素霞[1] 王昕[1] 陈雪峰[2] 王侃[1] 曹槐[1] 张闻[3] 刘次全[1] 

机构地区：[1]云南大学现代理论生物研究中心 [2]第四军医大学唐都医院,西安710033 [3]昆明医学院生物学教研室,昆明650031

出　　处：《科学通报》2008年第2期203-209,共7页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(批准号:90208018,39970412和90303018);中国科学院知识创新工程前沿交叉项目(批准号:KJCX1-08)

摘　　要：以H5N1亚型禽流感病毒(avianin fluenza viruses,AIV)毒株血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,研究其密码子的偏好性及对应mRNA序列折叠二级结构的特点.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.结果表明,裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤(A)的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,极少数位于配对螺旋区.此外,本研究还从理论上提出了防治H5N1亚型AIV感染的对策,考虑以位于环区的mRNA核苷酸,运用RNAi的方法阻止H5N1亚型AIV的HA的表达。

关 键 词：禽流感 血凝素 裂解位点 动态折叠 MRNA二级结构 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]