MRNA二级结构

作品数：30被引量：101H指数：5
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运用翻译起始区结构优化实现广谱抗病毒蛋白PA在大肠杆菌中的高效表达
《中国生物工程杂志》2024年第9期53-63,共11页李秋烨 谢德健 史姝 蔡秀怡 谭志霞 张彦 沈文龙 叶湘漓 赵志虎 
国家科技重大专项(2018ZX10305410);国家自然科学基金(31370762);湖南省卫生健康委员会重点项目(202201065690)资助项目。
大肠杆菌是重要的生物工程宿主系统,约1/3上市蛋白质类生物技术药物由大肠杆菌重组生产。但是,密码子偏性所致目的蛋白表达水平较低、不具备真核生物部分翻译后修饰等多种因素,限制了大肠杆菌系统的广泛应用。广谱抗病毒蛋白,对类似新...
关键词：大肠杆菌 原核表达 翻译起始区 MRNA二级结构 密码子优化 
史宾格犬ASIC1基因SNPs对mRNA二级结构的影响
《中国工作犬业》2023年第11期48-50,共3页朱程程 程占军 万宁 佘奕 李来有 
LGZD202303项目资助。
胞外pH值的下降能激活一种在体内广泛分布的特殊配体门控通道,即酸敏感离子通道(scid-sensing ion channels, ASICs)。ASICs也称作H+门控离子通道,是上皮钠离子通道/退化蛋白(ENaC/DEG)超家族一个分支。ASICs由5个功能基因编码,分别为AS...
关键词：中枢神经系统 酸敏感离子通道 感觉神经元 上皮钠离子通道 MRNA二级结构 
mRNA序列固有特征与翻译延伸速率的统计相关性
《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》2022年第4期301-308,共8页王哲 张颖 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2022LHMS03014)。
统计了酿酒酵母基因组中mRNA密码子使用和茎环结构与翻译延伸速率的相关性。结果表明,所有稀有密码子都具有慢速解码的特点,富含GC比富含AU的密码子解码速度更慢。在密码子水平上,纯茎(环)结构对快慢翻译速率的偏好性不明显,而当一个密...
关键词：翻译延伸速率 密码子 MRNA二级结构 偏好性指数 
L-天冬氨酸-α-脱羧酶基因5′端二级结构对重组表达的抑制机制及消除策略
《食品与发酵工业》2019年第16期1-10,共10页令狐梅 韩来闯 周哲敏 崔文璟 
国家自然科学基金-青年基金(31400058)
探究赤拟谷盗Tribolium castaneum L-天冬氨酸-α-脱羧酶(PanD)与人工高效表达元件适配过程中翻译抑制产生的机制,并发展新的消除策略.首先在枯草芽孢杆菌中利用高效表达元件验证翻译抑制现象并分析了翻译抑制产生的机制,同时融合sfGFP...
关键词：L-天冬氨酸-α-脱羧酶 MRNA二级结构 N端截断 融合肽 枯草芽孢杆菌 
藤壶cp19k基因mRNA二级结构对其在大肠杆菌中表达的影响被引量：1
《军事医学》2019年第6期401-405,共5页徐臻臻 刘青 付文亮 李伍举 邢薇薇 王园园 徐东刚 刘中成 
国防基础科研计划(JCKY2018548C001)
目的探究藤壶cp19k基因5′端mRNA二级结构对其在大肠杆菌中表达的影响。方法通过对3个藤壶物种的cp19k基因(balcp19k、mrcp19k、bicp19k)序列进行分析,并利用大肠杆菌密码子偏好性对其进行优化,将优化后的3个基因序列利用BioSun软件分析...
关键词：cp19k 藤壶胶 基因表达 MRNA二级结构 自由能 大肠杆菌 仿生材料 
mRNA环结构对蛋白质折叠速率的影响被引量：10
《生物化学与生物物理进展》2018年第6期672-678,共7页李瑞芳 李宏 郭春阳 杨萨如拉 
国家自然科学基金(31260219);教育部博士点基金(20121501110006);内蒙古自治区自然科学基金(2016MS0362);内蒙古高等学校科学技术研究(NJZY17043)资助项目~~
前期的相关研究发现mRNA二级结构中存在对蛋白质折叠速率的重要影响因素.而mRNA二级结构中普遍存在着各种复杂的环结构,这些环结构是否对蛋白质折叠速率也有重要的影响呢?不同的环结构对蛋白质折叠速率的影响是否相同呢?基于此想法,建...
关键词：MRNA二级结构 内部环 发夹环 膨胀环 多分支环 蛋白质折叠速率 
基于mRNA 5’端TIR区二级结构优化提高重组sTNFαRI在大肠杆菌中的表达水平
《中国生物工程杂志》2018年第3期62-69,共8页秦娇荣 赵兆 罗心梅 李春阳 
目的：通过优化PET11b-s TNFαRI 5＇mRNA翻译起始区（TIR）二级结构从而提高可溶性肿瘤坏死因子I型受体（sTNFαRI）在大肠杆菌[E.coli BL21（DE3）]中的表达水平。方法：通过对PET11b-s TNFαRI mRNA 5＇端TIR区二级结构的自由能及核...
关键词：sTNFαRI MRNA二级结构 翻译起始区 自由能 
多种信息融合的细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位预测
《计算生物学》2016年第3期62-71,共10页薛济先 陈颖丽 翟媛媛 
国家自然科学基金(61361015);教育部第46批留学回国人员科研启动基金的支持。
研究表明mRNA的序列和结构特性与蛋白质的亚细胞定位有一定关系。本文提取了细胞凋亡蛋白质的两种mRNA信息:三阅读框3-mer mRNA序列频数信息、mRNA二级结构-序列模式信息,并结合细胞凋亡蛋白质的氨基酸物理化学性质、氨基酸黏性特征和...
关键词：细胞凋亡蛋白 MRNA二级结构 亚细胞定位 
冠状病毒同义密码子使用对mRNA二级结构的影响
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2015年第6期609-618,共10页黄俏 李瑞芳 于志芬 李雪 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2012MS0115);内蒙古自治区研究生教育创新计划资助项目(S20141013523);内蒙古师范大学研究生科研创新基金资助项目(CXJJS14061)
从NCBI中获得了45种冠状病毒的mRNA序列总计416条.分别计算了每条编码序列中相对同义密码子使用度(RSCU),然后预测每条mRNA序列的RNA二级结构,计算相应mRNA茎结构含量、环结构含量、单位平均折叠自由能以及mRNA柔性.由此,建立了冠状病毒...
关键词：冠状病毒 同义密码子使用度 MRNA二级结构 折叠自由能 mRNA柔性 
一个蛋白质相似性搜索问题的近似算法
《工程数学学报》2014年第4期484-492,共9页李红武 王骁力 尚耐丽 
国家自然科学基金(41306207;51349006)~~
本文研究了一个蛋白质相似性搜索问题,即在满足mRNA二级结构互补约束且不含终止密码子的条件下,寻找与给定的mRNA和蛋白质有最大相似性的mRNA序列和编码氨基酸序列的问题,简称MRSOS问题.讨论了该问题的复杂性,同时,结合RNA分子二级结构...
关键词：蛋白质相似性 MRNA二级结构 终止密码子 近似算法 
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